Art

J-GLOBAL ID：201402286424183566   Reference number：14A1263368

Methods for analyzing next-generation sequencing data I. Introduction

次世代シーケンサーデータの解析手法 第1回 イントロダクション

Author (5)： KADOTA KOJI (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SUN Jianqiang (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  TANG Min (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  NISHIOKA TASUKU (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SHIMIZU KENTARO (東大 大学院農学生命科学研究科)
Material： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
Volume： 25  Issue： 2  Page： 87-94  Publication year： Jul. 05, 2014 
JST Material Number： L3534A  ISSN： 1343-327X  Document type： Article
Article type： 解説  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： automatic analyser ,...
Semi thesaurus term： genome analysis ,...

Register(free) or Log In to access     To see more with JDream III (charged).   {{ this.onShowAbsJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=14A1263368&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=L3534A") }}

JST classification (1)： Research methods in genetics  (EC01020N)

Reference (37)：

• Kawano, S., Ono, H., Takagi, T., Bono, H.: Tutorial videos of bioinformatics resources: online distribution trial in Japan named TogoTV, Brief Bioinform., 13,258-268 (2012).
• Field, D., Tiwari, B., Booth, T., Houten, S., Swan, D., Bertrand, N., Thurston, M.: Open software for biologists: from famine to feast. Nat. Biotechnol., 24,801-803 (2006).
• Simpson, J.T., Wong, K., Jackman, S.D., Schein, J.E., Jones, S.J., Birol, I.: ABySS: a parallel assembler for short read sequence data. Genome Res., 19,1117-1123 (2009).
• Zerbino, D.R. and Birney, E.: Velvet: algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs. Genome Res., 18,821-829 (2008).
• Langmead, B. and Salzberg, S.L.: Fast gapped-read alignment with Bowtie 2. Nat. Methods, 9, 357-359 (2012).

Terms in the title (2)： 次世代シーケンサー ,  解析手法