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J-GLOBAL ID：201402287080714016   Reference number：14A0007430

Chromosome-scale scaffolding of de novo genome assemblies based on chromatin interactions

クロマチン相互作用に基づく新規ゲノムアセンブリーの染色体レベルのスキャフォールド構築

Author (6)： BURTON Joshua N (Univ. Washington, Washington, USA) ,  ADEY Andrew (Univ. Washington, Washington, USA) ,  PATWARDHAN Rupali P (Univ. Washington, Washington, USA) ,  QIU Ruolan (Univ. Washington, Washington, USA) ,  KITZMAN Jacob O (Univ. Washington, Washington, USA) ,  SHENDURE Jay (Univ. Washington, Washington, USA)
Material： Nature Biotechnology  (Nat Biotechnol)
Volume： 31  Issue： 12  Page： 1119-1125  Publication year： Dec. 2013 
JST Material Number： H0870A  ISSN： 1087-0156  Document type： Article
Article type： 原著論文  Country of issue： United States (USA)  Language： ENGLISH (EN)

Thesaurus term： human(primates) ,  chromosome ,  *nucleotide sequence ,  mouse(animal) ,  Drosophila ,  *chromatin ,  protocol ,  *automatic analyser ,  *intermolecular interaction ,  *algorithm ,  cellular genetic phenomenon ,  *genome ,  *clone ,  *clustering ,  *simulation
Semi thesaurus term： de novoゲノムアセンブリ ,  Hi-Cデータセット ,  Hi-Cプロトコル ,  *LACHESISアルゴリズム ,  *クロマチン相互作用 ,  *ゲノムアセンブリスキャフォールド構築 ,  *genomic sequence ,  *contig ,  近接連結法 ,  *next generation sequencer

JST classification (3)： Molecular and genetic information processing  (JE15040B) ,  Structure and chemistry of genes  (EC02020U) ,  Computer simulation  (JE11000H)

Terms in the title (7)： クロマチン ,  相互作用 ,  ゲノム ,  アセンブリー ,  染色体 ,  スキャフォールド ,  構築