HLA遺伝子のマルチプレックスDNAタイピング方法及びキット

Inventor： , , , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：内田直人
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2013099547
Publication number (International publication number)：2014217332
Application date： May. 09, 2013
Publication date： Nov. 20, 2014
Summary：

【課題】ハイスループットシークエンサーを駆使し、フェーズ・アンビギュイティに由来する曖昧さを排除した高精度のDNAタイピング方法及びキットを提供することを目的とする。【解決手段】本発明は、(1)ヒトゲノム塩基配列におけるHLAクラスI及びクラスIIに属する遺伝子から選択される少なくとも2種の遺伝子の上流領域及び下流領域に各々特異的にハイブリダイズし、かつ同一のPCR条件にて増幅するプライマーセットを準備するステップ;(2)前記プライマーセットを用いて、被検試料(DNA)中の前記少なくとも2種の遺伝子を同一のPCR条件で同時に同一容器内で増幅するステップ;(3)PCR産物の塩基配列を決定するステップ;及び(4)任意に、データベースとのホモロジー検索を実施するステップを含むことを特徴とする、HLAのDNAタイピング方法を提供する。【選択図】図11

Claim (excerpt)：

(1)ヒトゲノム塩基配列におけるHLAクラスI及びクラスIIに属する遺伝子から選択される少なくとも2種の遺伝子の上流領域及び下流領域に各々特異的にハイブリダイズし、かつ同一のPCR条件にて増幅するプライマーセットを準備するステップ; (2)前記プライマーセットを用いて、被検試料(DNA)中の前記少なくとも2種の遺伝子を同一のPCR条件で同時に同一容器内で増幅するステップ; (3)PCR産物の塩基配列を決定するステップ;及び (4)任意に、データベースとのホモロジー検索を実施するステップ; を含むことを特徴とする、HLAのDNAタイピング方法。

IPC (1)：

C12Q 1/68

FI (1)：

C12Q1/68 Z

F-Term (13)：

4B024AA11 , 4B024CA04 , 4B024CA09 , 4B024CA20 , 4B024HA12 , 4B063QA13 , 4B063QQ43 , 4B063QQ79 , 4B063QR32 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QS16 , 4B063QS25

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

リステリア菌の検出・同定方法
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2006-144723 Applicant：国立大学法人九州大学, 明治乳業株式会社

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (4)

次世代シークエンサーを用いたHLAクラスI遺伝子の超高解像度DNAタイピング(Super high resolution Single
次世代シークエンサーを用いたHLA-DRB1遺伝子の超高解像度DNAタイピング(Super high resolution Single mo
臨床と微生物, 2004, vol.31, no.2, p.111-115

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