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J-GLOBAL ID:201410007527897553
Research Resource code:NBDC00714
Update date:Jan. 13, 2022
TMFunction (Archive): Functional Database of Membrane Proteins
TMFunction(アーカイブ): Functional Database of Membrane Proteins
Owning Organization:
Resource classification:
Data,Database
Tag (subject) (1):
Protein
Tag (data type) (1):
Sequence
Species (34):
Bacillus halodurans (NCBI Taxonomy ID: 86665)
, Bacteriophage M13 (NCBI Taxonomy ID: 1977402)
, Bordetella pertussis (NCBI Taxonomy ID: 520)
, Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913)
, Carassius auratus (NCBI Taxonomy ID: 7957)
, Clostridium botulinum (NCBI Taxonomy ID: 1491)
, Corynebacterium diphtheriae (NCBI Taxonomy ID: 1717)
, Cricetulus griseus (NCBI Taxonomy ID: 10029)
, Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955)
, Emericella nidulans (NCBI Taxonomy ID: 162425)
, Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562)
, Escherichia coli O157 (NCBI Taxonomy ID: 1045010)
, Escherichia coli UTI89 (NCBI Taxonomy ID: 364106)
, Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031)
, Helicobacter pylori (NCBI Taxonomy ID: 210)
, Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
, Human herpesvirus 8 (NCBI Taxonomy ID: 37296)
, Leishmania donovani (NCBI Taxonomy ID: 5661)
, Manduca sexta (NCBI Taxonomy ID: 7130)
, Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
, Oryctolagus cuniculus (NCBI Taxonomy ID: 9986)
, Pongo pygmaeus (NCBI Taxonomy ID: 9600)
, Pseudomonas aeruginosa (NCBI Taxonomy ID: 287)
, Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116)
, Rhodobacter sphaeroides (NCBI Taxonomy ID: 1063)
, Rhodopseudomonas blastica (NCBI Taxonomy ID: 1075)
, Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932)
, Saimiri boliviensis (NCBI Taxonomy ID: 27679)
, Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (NCBI Taxonomy ID: 90371)
, Shigella dysenteriae (NCBI Taxonomy ID: 622)
, Staphylococcus aureus (NCBI Taxonomy ID: 1280)
, Vibrio parahaemolyticus (NCBI Taxonomy ID: 670)
, Xenopus (NCBI Taxonomy ID: 8353)
, Xenopus laevis (NCBI Taxonomy ID: 8355)
Overview:
α-ヘリックスおよびβ-バレル膜タンパク質中の機能的に重要な残基についてのデータベースです。タンパク質の基本情報やアミノ酸の修飾、変異情報の他、親和性、解離定数、IC50、活性などの実験値を格納しています。実験データは文献から収集しています。Uniprot、PDB、Pubmedなど様々な公共データベースへのリンクを持ちます。
国立研究開発法人産業技術総合研究所によるオリジナルサイト (http: //tmbeta-genome.cbrc.jp/TMFunction/) の運用は終了しました。TMFunctionのデータは引き続き生命科学系データベースアーカイブよりご利用いただけます。
Source:
NBDC
Record maintainer:
Integbio Database Catalog
Record license:
Creative Commons CC0 license
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