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J-GLOBAL ID:201410031366947995   Research Resource code:NBDC00798 Update date:May. 27, 2018

LfDB: Lectin Frontier Database

LfDB: Lectin Frontier Database
Owning Organization:
Resource classification: Database
Tag (subject)  (2): Protein ,  Carbohydrate
Tag (data type)  (3): Interaction/Pathway ,  Image/Movie ,  Chemical structure
Species (140): Abrus precatorius (NCBI Taxonomy ID: 3816) ,  Agaricus bisporus (NCBI Taxonomy ID: 5341) ,  Agrocybe cylindracea (NCBI Taxonomy ID: 64608) ,  Aleuria aurantia (NCBI Taxonomy ID: 5188) ,  Allium sativum (NCBI Taxonomy ID: 4682) ,  Amaranthus caudatus (NCBI Taxonomy ID: 3567) ,  Amaranthus cruentus (NCBI Taxonomy ID: 117272) ,  Anabaena sp. (NCBI Taxonomy ID: 1167) ,  Anguilla anguilla (NCBI Taxonomy ID: 7936) ,  Arachis hypogaea (NCBI Taxonomy ID: 3818) ,  Artocarpus heterophyllus (NCBI Taxonomy ID: 3489) ,  Arum maculatum (NCBI Taxonomy ID: 4458) ,  Aspergillus kawachii IFO 4308 (NCBI Taxonomy ID: 1033177) ,  Aspergillus oryzae (NCBI Taxonomy ID: 5062) ,  Balanus roseus (NCBI Taxonomy ID: 509123) ,  Balanus rostratus (NCBI Taxonomy ID: 399131) ,  Bauhinia purpurea (NCBI Taxonomy ID: 3806) ,  Bitis arietans (NCBI Taxonomy ID: 8692) ,  Boletopsis leucomelas (NCBI Taxonomy ID: 178527) ,  Boletus (NCBI Taxonomy ID: 5369) ,  Bondarzewia mesenterica (NCBI Taxonomy ID: 1095465) ,  Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) ,  Bothrops jararaca (NCBI Taxonomy ID: 8724) ,  Bufo arenarum (NCBI Taxonomy ID: 38577) ,  Calystegia sepium (NCBI Taxonomy ID: 47519) ,  Canavalia brasiliensis (NCBI Taxonomy ID: 61861) ,  Canavalia ensiformis (NCBI Taxonomy ID: 3823) ,  Capsicum annuum (NCBI Taxonomy ID: 4072) ,  Caragana arborescens (NCBI Taxonomy ID: 20484) ,  Castanea crenata (NCBI Taxonomy ID: 103480) ,  Ceratobasidium cornigerum (NCBI Taxonomy ID: 5252) ,  Chlorophyllum molybdites (NCBI Taxonomy ID: 34430) ,  Cicer arietinum (NCBI Taxonomy ID: 3827) ,  Clostridium botulinum (NCBI Taxonomy ID: 1491) ,  Colchicum autumnale (NCBI Taxonomy ID: 45005) ,  Conger myriaster (NCBI Taxonomy ID: 7943) ,  Convolvulus arvensis (NCBI Taxonomy ID: 4123) ,  Cortinarius praestans (NCBI Taxonomy ID: 222043) ,  Cratylia mollis (NCBI Taxonomy ID: 252530) ,  Crotalus atrox (NCBI Taxonomy ID: 8730) ,  Cucumaria echinata (NCBI Taxonomy ID: 40245) ,  Cycas revoluta (NCBI Taxonomy ID: 3396) ,  Cytisus scoparius (NCBI Taxonomy ID: 3835) ,  Datura stramonium (NCBI Taxonomy ID: 4076) ,  Dioclea grandiflora (NCBI Taxonomy ID: 3837) ,  Dioscorea batatas (NCBI Taxonomy ID: 55575) ,  Diospyros kaki (NCBI Taxonomy ID: 35925) ,  Dolichos lablab (NCBI Taxonomy ID: 35936) ,  Echis multisquamatus (NCBI Taxonomy ID: 93050) ,  Erythrina caffra (NCBI Taxonomy ID: 3842) ,  Erythrina corallodendron (NCBI Taxonomy ID: 3843) ,  Erythrina crista-galli (NCBI Taxonomy ID: 49817) ,  Erythrina lysistemon (NCBI Taxonomy ID: 347910) ,  Erythrina vespertilio (NCBI Taxonomy ID: 1234622) ,  Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) ,  Euonymus europaeus (NCBI Taxonomy ID: 123417) ,  Galanthus nivalis (NCBI Taxonomy ID: 4670) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) ,  Geodia cydonium (NCBI Taxonomy ID: 6047) ,  Giardia lamblia (NCBI Taxonomy ID: 5741) ,  Glycine max (NCBI Taxonomy ID: 3847) ,  Griffonia simplicifolia (NCBI Taxonomy ID: 3850) ,  Haemophilus ducreyi (NCBI Taxonomy ID: 730) ,  Halichondria okadai (NCBI Taxonomy ID: 163232) ,  Helianthus tuberosus (NCBI Taxonomy ID: 4233) ,  Helicobasidium purpureum (NCBI Taxonomy ID: 5574) ,  Helix aspersa (NCBI Taxonomy ID: 6535) ,  Helix pomatia (NCBI Taxonomy ID: 6536) ,  Hemitripterus americanus (NCBI Taxonomy ID: 8094) ,  Hericium erinaceum (NCBI Taxonomy ID: 91752) ,  Hippeastrum hybrid cultivar (NCBI Taxonomy ID: 679627) ,  Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Human herpesvirus 4 (NCBI Taxonomy ID: 10376) ,  Hydra vulgaris (NCBI Taxonomy ID: 6087) ,  Hypnea japonica (NCBI Taxonomy ID: 105606) ,  Hypsizygus marmoreus (NCBI Taxonomy ID: 39966) ,  Laetiporus sulphureus (NCBI Taxonomy ID: 5630) ,  Lens culinaris (NCBI Taxonomy ID: 3864) ,  Limax flavus (NCBI Taxonomy ID: 36461) ,  Limulus polyphemus (NCBI Taxonomy ID: 6850) ,  Lotus tetragonolobus (NCBI Taxonomy ID: 3868) ,  Lumbricus terrestris (NCBI Taxonomy ID: 6398) ,  Lycopersicon esculentum (NCBI Taxonomy ID: 4081) ,  Lycoris traubii (NCBI Taxonomy ID: 82237) ,  Maackia amurensis (NCBI Taxonomy ID: 37501) ,  Maclura pomifera (NCBI Taxonomy ID: 3496) ,  Macrotyloma uniflorum (NCBI Taxonomy ID: 271171) ,  Momordica charantia (NCBI Taxonomy ID: 3673) ,  Morus nigra (NCBI Taxonomy ID: 85232) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Musa acuminata (NCBI Taxonomy ID: 4641) ,  Narcissus pseudonarcissus (NCBI Taxonomy ID: 39639) ,  Nostoc sp. (NCBI Taxonomy ID: 1180) ,  Oncorhynchus keta (NCBI Taxonomy ID: 8018) ,  Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530) ,  Parkia platycephala (NCBI Taxonomy ID: 185447) ,  Phaseolus lunatus (NCBI Taxonomy ID: 3884) ,  Phaseolus vulgaris (NCBI Taxonomy ID: 3885) ,  Phlebodium aureum (NCBI Taxonomy ID: 218620) ,  Phytolacca americana (NCBI Taxonomy ID: 3527) ,  Pisum sativum (NCBI Taxonomy ID: 3888) ,  Plecoglossus altivelis (NCBI Taxonomy ID: 61084) ,  Pleurotus ostreatus (NCBI Taxonomy ID: 5322) ,  Polyandrocarpa misakiensis (NCBI Taxonomy ID: 7723) ,  Polygonatum multiflorum (NCBI Taxonomy ID: 45371) ,  Psathyrella velutina (NCBI Taxonomy ID: 71681) ,  Pseudomonas aeruginosa (NCBI Taxonomy ID: 287) ,  Psophocarpus tetragonolobus (NCBI Taxonomy ID: 3891) ,  Pteria penguin (NCBI Taxonomy ID: 113549) ,  Rana catesbeiana (NCBI Taxonomy ID: 8400) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Rattus rattus (NCBI Taxonomy ID: 10117) ,  Rhizoctonia solani (NCBI Taxonomy ID: 456999) ,  Ricinus communis (NCBI Taxonomy ID: 3988) ,  Salvia viridis (NCBI Taxonomy ID: 49221) ,  Sambucus ebulus (NCBI Taxonomy ID: 28503) ,  Sambucus nigra (NCBI Taxonomy ID: 4202) ,  Sambucus sieboldiana (NCBI Taxonomy ID: 45463) ,  Scilla campanulata (NCBI Taxonomy ID: 81759) ,  Sclerotinia (NCBI Taxonomy ID: 5179) ,  Sinularia lochmodes (NCBI Taxonomy ID: 301888) ,  Solanum tuberosum (NCBI Taxonomy ID: 4113) ,  Sophora japonica (NCBI Taxonomy ID: 3897) ,  Spirinchus lanceolatus (NCBI Taxonomy ID: 136040) ,  Streptomyces lividans (NCBI Taxonomy ID: 1916) ,  Streptomyces olivaceoviridis (NCBI Taxonomy ID: 1921) ,  Sus scrofa (NCBI Taxonomy ID: 9823) ,  Tachypleus tridentatus (NCBI Taxonomy ID: 6853) ,  Trichosanthes kirilowii var. japonica (NCBI Taxonomy ID: 61011) ,  Trimeresurus flavoviridis (NCBI Taxonomy ID: 88087) ,  Triticum aestivum (NCBI Taxonomy ID: 4565) ,  Tulipa gesneriana (NCBI Taxonomy ID: 13306) ,  Ulex europaeus (NCBI Taxonomy ID: 3902) ,  Urtica dioica (NCBI Taxonomy ID: 3501) ,  Vicia faba (NCBI Taxonomy ID: 3906) ,  Vicia villosa (NCBI Taxonomy ID: 3911) ,  Vigna radiata (NCBI Taxonomy ID: 157791) ,  Viscum album (NCBI Taxonomy ID: 3972) ,  Wisteria floribunda (NCBI Taxonomy ID: 3922) ,  Xenopus laevis (NCBI Taxonomy ID: 8355)
Overview:
This database contains information about the quantity of interactions noted among a series of lectins and a panel of pyridylaminated (PA) glycans when exposed to an automated frontal affinity chromatography with fluorescence detection (FAC-FD) system. The data is presented in a bar graph format containing the affinity constants (Ka) of the lectins towards the glycans or, alternatively, an actual measurement (V-V0). It also provides the absolute values of sugar-protein interactions.

The information provided can be relied upon to be accurate and therefore this database is a valuable resource in biological studies of glycans.

Keyword and advanced search options are provided.
Source: NBDC
Record maintainer: Integbio Database Catalog
Record license: Creative Commons CC0 license

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