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J-GLOBAL ID：201410056200728007
Research Resource code：NBDC00090
Update date：Aug. 06, 2017
GTOP (Rice version): Genomes to protein structures and functions
GTOP (Rice version): Genomes to protein structures and functions
Owning Organization：
-
NARO (National Agriculture and Food Research Organization)
Resource classification：
Data,Database
Tag (subject) (1)：
Protein
Tag (data type) (2)：
Sequence
, 3D structure
Species (1)：
Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530)
Overview：
国立遺伝学研究所が公開している「GTOP」のイネ限定版です。GTOPはゲノムにコードされる全タンパク質の配列データを解析した結果をまとめたデータベースで、配列相同性解析を主な手段としており、立体構造予測(対PDBの配列相同性検索。Reverse PSI-BLASTを使用)、機能予測(対Swissprotの配列相同性検索。BLASTを使用)、モチーフ解析(PROSITE)、ファミリー分類(Pfam)、膜貫通ヘリックス予測(SOSUI)、コイルドコイル予測(Multicoil)、繰り返し配列解析(RepAlign)の結果が収録されています。
Source：
NBDC
Record maintainer：
Integbio Database Catalog
Record license：
Creative Commons CC0 license
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