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J-GLOBAL ID:201410074850147635   Research Resource code:NBDC01210 Update date:Mar. 06, 2017

BriX

BriX
Owning Organization:
  • Flanders Institute of Biotechnology, Free University of Brussels
Resource classification: Database
Tag (subject)  (1): Protein
Tag (data type)  (2): Sequence ,  Image/Movie
Overview:
主鎖骨格の類似性によりクラスタリングされたタンパク質断片のデータベースです。登録されているタンパク質断片は、Astral40のデータセットから取得した7290のタンパク質について4~14アミノ酸残基で断片化し、6種類の異なる閾値を用いて主鎖骨格の類似性によりクラスタリングを行っています。また、Loop BriXではAstral95のデータセットから取得した14.525のタンパク質からのループ断片について、両端間距離およびアンカー残基の重ね合わせによるクラスタリングを行った結果が登録されています。
Source: NBDC
Record maintainer: Integbio Database Catalog
Record license: Creative Commons CC0 license

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