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J-GLOBAL ID:201410089981219590   Research Resource code:NBDC00282 Update date:Aug. 10, 2020

RIKEN Hub Database Project

RIKEN Hub Database Project
Resource classification: Database
Tag (subject)  (2): Genome/Gene ,  cDNA/EST
Tag (data type)  (1): Expression
Species (4): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) ,  Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702)
Overview:
タイリングアレイ(遺伝子発現情報)とゲノム情報を組み合わせて統計的に解析することにより、遺伝子の構造を高い精度で推定する新しい情報処理技術を開発しました。この技術をシロイヌナズナのデータに適用し、これまでに知られている約2万7千の遺伝子領域のほかにも、約5千2百箇所の領域で発現している新たな遺伝子構造を見出し公開しています。遺伝子のネットワークや変異体の有無に関する情報もあわせて提供しています。「Forward Genetics」、「Reverse Genetics」、「Data Integration」、「Estimation of Candidate Genes」を連携させた「統合Genetics」としてのシステムであり、また、この処理を行うために独自に開発したプログラムARTADE(アートエード)の全ソースコード(プログラム内容)も公開しています。近年のゲノミクスの発展によって、膨大な量の公開データとバイオリソースの蓄積が進行しています。これらをバイオインフォマティクスによって統合化し、より効率的な原因遺伝子探索のストラテジーを作り出すことを目的としています。
Source: NBDC
Record maintainer: Integbio Database Catalog
Record license: Creative Commons CC0 license

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