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J-GLOBAL ID:201501064712955612   Update date: May. 06, 2021

Yoshidome Takashi

ヨシドメ タカシ | Yoshidome Takashi
Affiliation and department:
Job title: Assistant Professor
Homepage URL  (2): https://sites.google.com/view/takashiyoshidome-wp/%E3%83%9B%E3%83%BC%E3%83%A0http://db.tohoku.ac.jp/whois/e_detail/2121f95d76955d5340203f66c6d2f574.html
Research field  (2): Biophysics ,  Bio-, chemical, and soft-matter physics
Research keywords  (9): 電子顕微鏡 ,  溶媒和・水和 ,  積分方程式理論 ,  コヒーレントX線回折イメージング ,  密度汎関数理論 ,  自由エネルギーランドスケープ ,  ガラス転移 ,  マニフォールドラーニング ,  タンパク質
Research theme for competitive and other funds  (7):
  • 2021 - 2024 「水和」創薬理論の創生
  • 2021 - 2023 アミノ酸置換に基づく生体発動分子の運動制御理論の構築
  • 2020 - 2021 革新的4次元イメージング法:生体分子構造変化の高解像度解析への挑戦
  • 2018 - 2021 溶液理論計算と人工知能の融合によるタンパク質リガンド結合予測法の開発
  • 2018 - 2020 低温電子顕微鏡を用いた革新的4次元イメージング法の確立
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Papers (36):
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MISC (39):
  • Takashi Yoshidome, Yuki Sekiguchi, Tomotaka Oroguchi, Masayoshi Nakasako, Mitsunori Ikeguchi. Reconstruction of Three-Dimensional Structures of a Protein with Software ENMA and EMC Algorithm: A Simulation for XFEL-CXDI Experiment. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2017. 112. 3. 288A-288A
  • Takashi Yoshidome, Toru Ekimoto, Nobuyuki Matubayasi, Yuichi Harano, Masahiro Kinoshita, Mitsunori Ikeguchi. An Accurate and Efficient, Computational Method for the Hydration Free Energy of Large and Complex Molecules. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2016. 110. 3. 328A-329A
  • Takashi Yoshidome, Tomotaka Oroguchi, Masayoshi Nakasako, Mitsunori Ikeguchi. Classification Protocol of Projection Images by Manifold: Toward Analysis of Dynamics of Particles with Coherent X-Ray Diffraction Imaging. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2014. 106. 2. 384A-384A
  • T. Yoshidome, T. Ekimoto, N. Matubayasi, R. Roth, Y. Harano, M. Kinoshita, M. Ikeguchi. A novel computation method of hydration free energy: A hybrid of the method of energy representation and the morphometric approach. 7th Mini-Symposium on Liquids. 2013
  • 中迫雅由, 苙口友隆, 高山裕貴, 小林周, 児玉渉, 坂本啓太, 吉留崇, 池口満徳. コヒーレントX線回折イメージング構造解析理論の開発と展望. 放射光. 2013. 26. 11-25
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Lectures and oral presentations  (56):
  • 溶液理論で得たタンパク質水和の包括的解析
    (構造活性フォーラム2021 2021)
  • 3D-RISM理論を用いたリガンド結合サイトにおける水和の包括的解析
    (日本物理学会 第76回年次大会 2021)
  • 深層学習を用いたタンパク質水和分布の予測
    (生物物理学会 2020年度北海道支部-東北支部合同例会 2021)
  • 深層学習の視点に基づいたタンパク質水和分布法の高度化
    (生物物理学会 2020年度北海道支部-東北支部合同例会 2021)
  • 深層学習を用いたタンパク質構造変化の予測
    (生物物理学会 2020年度北海道支部-東北支部合同例会 2021)
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Professional career (1):
  • 博士(理学) (Kyushu University)
Committee career (3):
  • 2020/01 - 2020/12 日本生物物理学会 2020年分野別専門委員
  • 2018/05 - 2020/04 日本生物物理学会 東北支部会委員 会計
  • 2017/01 - 2017/12 日本生物物理学会 平成29年分野別専門委員
Awards (2):
  • 2019/12 - 第47回構造活性相関シンポジウム SAR Presentation Award (Poster presentation)
  • 2010/09/21 - 日本生物物理学会 第六回日本生物物理学会若手奨励賞
Association Membership(s) (6):
THE JAPANESE SOCIETY FOR SYNCHROTRON RADIATION RESEARCH ,  日本物理学会 ,  日本生物物理学会 ,  Biophysical Society ,  日本蛋白質科学会 ,  日本薬学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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