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J-GLOBAL ID：201502214984712910   Reference number：15A1303355

Methods for analyzing next-generation sequencing data V. assembly, mapping, and quality control

次世代シーケンサーデータの解析手法 第5回 アセンブル,マッピング,そしてQC

Author (3)： SUN Jianqiang (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SHIMIZU KENTARO (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  KADOTA KOJI (東大 大学院農学生命科学研究科)
Material： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
Volume： 26  Issue： 3  Page： 193-201  Publication year： Nov. 06, 2015 
JST Material Number： L3534A  ISSN： 1343-327X  Document type： Article
Article type： 原著論文  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： *automatic analyser ,...
Semi thesaurus term： Sequence Analysis, RNA ,...

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JST classification (2)： Molecular genetics in general  (EC02010J) ,  Microbiology(other than viruses)in general  (EG03010C)

Reference (40)：

• 1) 門田幸二(2015)平成26年度 バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム(次世代シークエン サ)速習コース 実施報告書,http://biosciencedbc.jp/gadget/human/h26_ngs_report.pdf
• 2) 門田幸二(2014)シリーズ Useful R 第 7 巻 トランスクリプトーム解析,金明哲 編,共立出版,東京.
• 3) 孫建強,湯敏,清水謙多郎,門田幸二(2015)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 4 回クオリティコントロールとプログラムのインストール.日本乳酸菌学会誌 26:124-132.
• 4) Field D, Tiwari B, Booth T, Houten S, Swan D, et al. (2006) Open software for biologists: from famine to feast. Nat Biotechnol 24: 801-803.
• 5) Lo CC, Chain PS. (2014) Rapid evaluation and quality control of next generation sequencing data with FaQCs. BMC Bioinformatics 15: 366.

Terms in the title (4)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  マッピング ,  QC