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J-GLOBAL ID：201502226564219689   Reference number：15A0458187

High-speed Similar Structure Search Method Using Geometrical Suffix Trees

幾何学的なサフィックス木による高速類似構造検索手法

Author (4)： TAKAHASHI YOSHIFUMI (広島市大 大学院情報科学研究科) ,  TAMURA KEIICHI (広島市大 大学院情報科学研究科) ,  KUROKI SUSUMU (広島市大 大学院情報科学研究科) ,  KITAKAMI HAJIME (広島市大 大学院情報科学研究科)
Material： 情報処理学会論文誌トランザクション データベース(Web)  (情報処理学会論文誌 データベース(Web))
Volume： 6  Issue： 5  Page： 62-70 (WEB ONLY)  Publication year： Dec. 27, 2013 
JST Material Number： U0476A  ISSN： 1882-7799  Document type： Article
Article type： 原著論文  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： *space structure ,...
Semi thesaurus term： *protein three-dimensional structure ,...

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JST classification (2)： Retrieval technology  (AC06020S) ,  Molecular and genetic information processing  (JE15040B)

Reference (31)：

• Shibuya, T.: Geometric Suffix Tree: A New Index Structure for Protein 3-D Structures, Combinatorial Pattern Matching 2006, LNCS 4009, pp.84-93 (2006).
• Shibuya, T.: Geometric Suffix Tree: Indexing Protein 3-D Structures, J. ACM, Vol.57, No.3, pp.15:1-15:17 (2010).
• 高橋誉文,黒木進,田村慶一,北上始:複数の蛋白質立体構造データに対するディスク版索引構造の構築方式,データ工学と情報マネジメントに関するフォーラムDEIM2009,電子情報通信学会データ工学研究専門委員会,p.8(2009).
• Takahashi, Y., Kuroki, S. and Kitakami, H.: Efficient Query Processing in Protein Structure Databases, Proc. 2nd International Workshop with Mentors on Databases, Web and Information Management for Young Researchers (iDB Workshop 2010), pp.47-55 (2010).
• Gao, F. and Zaki, M.J.: PSIST: Indexing Protein Structures Using Suffix Trees, Proc. IEEE Comput. Syst. Bioinform. Conf., pp.212-222 (2005).

Terms in the title (5)： 幾何学 ,  サフィックス木 ,  類似 ,  検索 ,  手法