Art

J-GLOBAL ID：201502270005766300   Reference number：15A0502786

Metagenetic community analysis of copepods using high throughput sequencing

超並列シーケンサーを用いたメタジェネティクスによるカイアシ類の群集構造解析

Author (6)： HIRAI JUN'YA (水産総合研究セ 中央水産研) ,  SHIMODE SHINJI (横浜国大 大学院環境情報研究院) ,  KURIYAMA MIKIKO (水産総合研究セ 中央水産研) ,  ICHIKAWA TADAFUMI (水産総合研究セ 中央水産研) ,  HIDAKA KIYOTAKA (水産総合研究セ 中央水産研) ,  TSUDA ATSUSHI (東大 大気海洋研)
Material： 日本プランクトン学会報  (Bulletin of Plankton Society of Japan)
Volume： 62  Issue： 1  Page： 73-78  Publication year： Feb. 25, 2015 
JST Material Number： Y0113A  ISSN： 0387-8961  Document type： Article
Article type： 解説  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： *Copepoda ,  *structure analysis ,  *genetics ,  *automatic analyser ,  zooplankton ,  oceanic circulation ,  biodiversity ,  nucleotide sequence ,  rRNA ,  biomarker
Semi thesaurus term： *genetics ,  *community structure ,  *next generation sequencer ,  food web ,  material cycle in the ocean ,  Locus Control Region ,  RNA, Ribosomal, 28S ,  genetic marker

JST classification (2)： Plankton  (FH02050R) ,  Animal ecology in general  (EE03010W)

Reference (19)：

• Beaugrand, G., K. M. Brander, J. A. Lindley, S. Souissi & P. C. Reid 2003. Plankton effect on cod recruitment in the North Sea. Nature 426: 661-664.
• Beaugrand, G., P. C. Reid, F. Ibañez, J. A. Lindley & M. Edwards 2002. Reorganization of North Atlantic marine copepod biodiversity and climate. Science 296: 1692-1694.
• Bucklin, A., S. Nishida, S. Schnack-Schiel, P. H. Wiebe, D. Lindsay, R. J. Machida & N. J. Copley 2010. A census of zooplankton of the global ocean, pp. 247-265. In Marine Life: Diversity, Distribution, and Abundance. (ed. McIntyre, A). Wiley-Blackwell, Oxford.
• Bucklin, A., D. Steinke & L. Blanco-Bercial 2011. DNA barcoding of marine metazoa. Ann. Rev. Mar. Sci. 3: 471-508.
• Edgar, R. C., B. J. Haas, J. C. Clemente, C. Quince & R. Knight 2011. UCHIME improves sensitivity and speed of chimera detection. Bioinformatics 27: 2194-2200.

Terms in the title (5)： シーケンサー ,  ジェネティクス ,  カイアシ類 ,  群集構造 ,  解析