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J-GLOBAL ID:201503017034390618

腸出血性大腸菌を検出及び同定する方法

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (5): 野河 信太郎 ,  甲斐 伸二 ,  金子 裕輔 ,  稲本 潔 ,  冨田 雅己
Gazette classification:公表公報
Application number (International application number):2015516741
Publication number (International publication number):2015519075
Application date: Jun. 14, 2013
Publication date: Jul. 09, 2015
Summary:
本発明は、サンプルがEHEC O157:[H7]、O145:[H28]、O103:[H2]、O111:[H8]、O121:[H19]、O26:[H11]、O45:[H2]又はO104:[H4]の少なくとも1つの血清型の腸出血性大腸菌(EHEC)を含むかどうかを予測する方法、及び遺伝子マーカーZ1151、Z1153、Z1154、Z1155、Z1156、Z6065、Z2098、ureD又はespVの少なくとも1つとの組合せでの遺伝子espKの検出及び/又は血清型特異的CRISPR配列の検出による前記血清型を同定する方法に関する。【選択図】なし
Claim (excerpt):
サンプルに存在すると疑われる腸出血性大腸菌(EHEC)の血清型を同定する方法であって、前記サンプル又は該サンプルから単離したDNAにおいて、以下の大腸菌CRISPR配列: a)- 配列番号1、配列番号2及び配列番号3のCRISPR配列であり、その1以上の存在がEHEC O157:[H7]の存在を示す配列;及び/又は - 配列番号4のCRISPR配列であり、その存在がEHEC O157:[H7]の存在を示す配列 から選択される、EHEC O157:[H7]同定用CRISPR配列; b) 配列番号5の配列であり、その存在がEHEC O145:[H28]の存在を示すEHEC O145:[H28]同定用CRISPR配列;及び c) 配列番号6の配列であり、その存在がEHEC O111:[H8]の存在を示すEHEC O111:[H8]同定用CRISPR配列;及び d) 配列番号7の配列であり、その存在がEHEC O121:[H19]の存在を示すEHEC O121:[H19]同定用CRISPR配列;及び e) 配列番号8の配列であり、その存在がEHEC O103:[H2]及び/又はEHEC O45:[H2]の存在を示すEHEC O103:[H2]及び/又はEHEC O45:[H2]同定用CRISPR配列;及び f) 配列番号9の配列であり、その存在がEHEC O104:[H4]の存在を示すEHEC O104:[H4]同定用CRISPR配列;及び g) 配列番号10の配列であり、その存在がEHEC O26:[H11]の存在を示すEHEC O26:[H11]同定用CRISPR配列 の存否を検出することを含んでなる、方法。
IPC (3):
C12Q 1/68 ,  C12N 15/09 ,  C12N 15/00
FI (3):
C12Q1/68 A ,  C12N15/00 A ,  C12N15/00
F-Term (18):
4B024AA15 ,  4B024CA02 ,  4B024CA09 ,  4B024CA20 ,  4B024GA19 ,  4B024HA12 ,  4B063QA01 ,  4B063QA07 ,  4B063QA14 ,  4B063QA19 ,  4B063QQ06 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR32 ,  4B063QR56 ,  4B063QR62 ,  4B063QS14 ,  4B063QS25 ,  4B063QX02
Patent cited by the Patent:
Cited by examiner (1)
Article cited by the Patent:
Cited by examiner (9)
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