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J-GLOBAL ID:201503017034390618
腸出血性大腸菌を検出及び同定する方法
Inventor:
,
,
Applicant, Patent owner:
Agent (5):
野河 信太郎
, 甲斐 伸二
, 金子 裕輔
, 稲本 潔
, 冨田 雅己
Gazette classification:公表公報
Application number (International application number):2015516741
Publication number (International publication number):2015519075
Application date: Jun. 14, 2013
Publication date: Jul. 09, 2015
Summary:
本発明は、サンプルがEHEC O157:[H7]、O145:[H28]、O103:[H2]、O111:[H8]、O121:[H19]、O26:[H11]、O45:[H2]又はO104:[H4]の少なくとも1つの血清型の腸出血性大腸菌(EHEC)を含むかどうかを予測する方法、及び遺伝子マーカーZ1151、Z1153、Z1154、Z1155、Z1156、Z6065、Z2098、ureD又はespVの少なくとも1つとの組合せでの遺伝子espKの検出及び/又は血清型特異的CRISPR配列の検出による前記血清型を同定する方法に関する。【選択図】なし
Claim (excerpt):
サンプルに存在すると疑われる腸出血性大腸菌(EHEC)の血清型を同定する方法であって、前記サンプル又は該サンプルから単離したDNAにおいて、以下の大腸菌CRISPR配列:
a)- 配列番号1、配列番号2及び配列番号3のCRISPR配列であり、その1以上の存在がEHEC O157:[H7]の存在を示す配列;及び/又は
- 配列番号4のCRISPR配列であり、その存在がEHEC O157:[H7]の存在を示す配列
から選択される、EHEC O157:[H7]同定用CRISPR配列;
b) 配列番号5の配列であり、その存在がEHEC O145:[H28]の存在を示すEHEC O145:[H28]同定用CRISPR配列;及び
c) 配列番号6の配列であり、その存在がEHEC O111:[H8]の存在を示すEHEC O111:[H8]同定用CRISPR配列;及び
d) 配列番号7の配列であり、その存在がEHEC O121:[H19]の存在を示すEHEC O121:[H19]同定用CRISPR配列;及び
e) 配列番号8の配列であり、その存在がEHEC O103:[H2]及び/又はEHEC O45:[H2]の存在を示すEHEC O103:[H2]及び/又はEHEC O45:[H2]同定用CRISPR配列;及び
f) 配列番号9の配列であり、その存在がEHEC O104:[H4]の存在を示すEHEC O104:[H4]同定用CRISPR配列;及び
g) 配列番号10の配列であり、その存在がEHEC O26:[H11]の存在を示すEHEC O26:[H11]同定用CRISPR配列
の存否を検出することを含んでなる、方法。
IPC (3):
C12Q 1/68
, C12N 15/09
, C12N 15/00
FI (3):
C12Q1/68 A
, C12N15/00 A
, C12N15/00
F-Term (18):
4B024AA15
, 4B024CA02
, 4B024CA09
, 4B024CA20
, 4B024GA19
, 4B024HA12
, 4B063QA01
, 4B063QA07
, 4B063QA14
, 4B063QA19
, 4B063QQ06
, 4B063QQ42
, 4B063QR32
, 4B063QR56
, 4B063QR62
, 4B063QS14
, 4B063QS25
, 4B063QX02
Patent cited by the Patent:
Article cited by the Patent:
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Journal of Clinical Microbiology, 50(11)(Epub 2012 Aug), pp.3485-3492
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Annu. Rev. Food Sci. Technol., 3(2012, First published online 2011 Dec), pp.143-162
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-
Distribution of Genetic Markers Useful for the Identification of Shiga Toxin-Negative O26 Escherichi
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