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J-GLOBAL ID：201503070580239871
緑膿菌の遺伝子型別分類法およびこれに用いるプライマーセット
Inventor：
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Applicant, Patent owner：
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Agent (1)：
特許業務法人特許事務所サイクス
Gazette classification：特許公報
Application number (International application number)：2012010593
Publication number (International publication number)：2013146244
Patent number：5707641
Application date： Jan. 23, 2012
Publication date： Aug. 01, 2013
Claim (excerpt)：
【請求項1】緑膿菌のゲノム上の、
(1)genomic isletを構成するオープンリーディングフレーム(ORF)、および
(2)ファージ由来遺伝子のORF、
の有無を任意の順で検出し、これらORFの有無の組み合わせにより遺伝子型別分類を行うステップを含む、緑膿菌の遺伝子型別分類法であって、
前記(1)のORFにおけるgenomic isletが、PSPA7_0045、PA2794 、PA14_20600 、PA1509、PA2119 、PA3065、PA4549、PA5264、PA1380およびPA14_10960からなる群より選ばれる少なくとも5種の遺伝子であり、前記(2)のORFにおける遺伝子が、PSPA7_0104、PLES_26051、PSPA7_5342、PSPA7_2363およびphage D3 p35からなる群より選ばれる少なくとも2種の遺伝子であり、
配列表の配列番号1と2、配列番号3と4、配列番号5と6、配列番号7と8、配列番号9と10、配列番号17と18、配列番号19と20、配列番号21と22、配列番号23と24、配列番号25と26に示された10組の塩基配列の組み合わせ(但し、上記塩基配列は、2塩基以下の塩基の付加、置換、欠失及び/又は挿入を有していてもよい)からなる10組のプライマーのうちの少なくとも5組のプライマーを用いて、PCR(polymerase chain reaction)法により前記(1)のORFの検出を行い、配列表の配列番号11と12、配列番号13と14、配列番号15と16、配列番号27と28、配列番号29と30に示された5組の塩基配列の組み合わせ(但し、上記塩基配列は、2塩基以下の塩基の付加、置換、欠失及び/又は挿入を有していてもよい)からなる5組のプライマーのうちの少なくとも2組のプライマーを用いて、PCR法により前記(2)のORFの検出を行う、
緑膿菌の遺伝子型別分類法。
IPC (3)：
C12N 15/09 ( 200 6.01)
, C12Q 1/04 ( 200 6.01)
, C12Q 1/68 ( 200 6.01)
C12N 15/00 A
, C12Q 1/04 ZNA
, C12Q 1/68 A
