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J-GLOBAL ID:201510083618912895   Research Resource code:NBDC01511

P-DIRECT ゲノム解析データポータル

P-DIRECT ゲノム解析データポータル
Owning Organization:
  • P-DIRECT
Resource classification: Database
Tag (subject)  (3): ゲノム/遺伝子 ,  エピジェネティクス ,  健康/疾患
Tag (data type)  (2): 配列 ,  ポータル
Species (1): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
Overview:
文部科学省 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム (P-DIRECT) の「がん臨床シーズ育成グループ」が解析した、がん組織を含む様々なヒト試料についての全エクソンシーケンスなどの網羅的ゲノム・エピゲノム情報のポータルサイトです。

がん種ごとにまとめた、アミノ酸置換を伴う体細胞変異のリスト(メタデータ)をオープンデータとして公開しています。2015年6月現在、肺がん、脳腫瘍、白血病、骨髄異形成症候群、胸膜胚芽種のデータセットが収録されています。また、実際の研究プロジェクトにおけるがん症例毎の塩基配列データ(bamファイル、fastqファイルなど)は、バイオサイエンスデータベースセンターのNBDCヒトデータベース ( http://humandbs.biosciencedbc.jp ) から利用申請を必要とする制限付きで提供します。



P-DIRECTによるゲノム解析データポータルの運用は終了しましたが、ポータル運用時のデータセットのがん種、検体数、NBDCヒトデータベースIDがこちら (http://data-portal.jp/pdirect) でご覧になれます。本プロジェクトによる成果データの一部はNBDCヒトデータベース ( http://humandbs.biosciencedbc.jp )から制限付きで提供されており、「利用可能な研究データ一覧」の提供者情報内に「P-DIRECT」という記載が含まれています。

関連リンク:AMED 次世代がん医療創生研究事業(P-CREATE): https://www.amed.go.jp/program/list/01/03/003.html
Source: NBDC
Record maintainer: Integbio Database Catalog
Record license: Creative Commons CC0 license

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