Yokoi Kakeru

Affiliation and department：

Research field (2)： Biological, health, and medical informatics , Entomology

Research keywords (3)：昆虫ゲノム科学 , バイオインフォマティクス , 昆虫分子生物学

Research theme for competitive and other funds (31)：

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Papers (34)：

Yudai Masuoka, Akiya Jouraku, Takuya Tsubota, Hirokazu Chiba, Hiromasa Ono, Hideki Sezutsu, Hidemasa Bono, Kakeru Yokoi. Time-course transcriptome data of silk glands in day 0-7 last-instar larvae of Bombyx mori (w1 pnd strain). BioRxiv. 2024
Ryusei Waizumi, Chikara Hirayama, Shuichiro Tomita, Tetsuya Iizuka, Seigo Kuwazaki, Akiya Jouraku, Takuya Tsubota, Kakeru Yokoi, Kimiko Yamamoto, Hideki Sezutsu. A major endogenous glycoside hydrolase mediating quercetin uptake in Bombyx mori. PLOS Genetics. 2024. 20. 1. e1011118-e1011118
Yudai Masuoka, Akiya Jouraku, Seigo Kuwazaki, Mikio Yoshiyama, Mari Horigane-Ogihara, Taro Maeda, Yutaka Suzuki, Hidemasa Bono, Kiyoshi Kimura, Kakeru Yokoi. Genome assembly reconstruction of the Japanese honey bee,Apis cerana japonica(Hymenoptera: Apidae), using homology-based assembly and nanopore long-reads. BioRxiv. 2023
Ryusei Waizumi, Takuya Tsubota, Akiya Jouraku, Seigo Kuwazaki, Kakeru Yokoi, Tetsuya Iizuka, Kimiko Yamamoto, Hideki Sezutsu. Highly accurate genome assembly of an improved high-yielding silkworm strain, Nichi01. G3 Genes|Genomes|Genetics. 2023
Daiki Kato, Ken Miura, Kakeru Yokoi. Analysis of the Toll and Spaetzle Genes Involved in Toll Pathway-Dependent Antimicrobial Gene Induction in the Red Flour Beetle, Tribolium castaneum (Coleoptera; Tenebrionidae). International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24. 2. 1523-1523

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MISC (18)：

横井翔, 瀬筒秀樹. カイコの遺伝子データ拡張とその利用. 農研機構技報. 2024. 15
KOBAYASHI TETSUYA, LIU CHIA-MING, HATAKEYAMA MASATSUGU, UEHARA TAKUYA, JOURAKU AKIYA, YOKOI KAKERU, MASUOKA YUDAI. I-3. Genome analysis of black soldier fly and its application in breeding. NIPPON SUISAN GAKKAISHI. 2023. 89. 5. 450-450
Ryusei Waizumi, Chikara Hirayama, Shuichiro Tomita, Tetsuya Iizuka, Seigou Kuwazaki, Akiya Jouraku, Takuya Tsubota, Kakeru Yokoi, Kimiko Yamamoto, Hideki Sezutsu. A major endogenous glycosidase mediating quercetin uptake in Bombyx mori. BioRxiv. 2023
坪田拓也, 増岡裕大, 横井翔, 高須陽子, 瀬筒秀樹. Analysis of the silk genes in the wild silkmoth, Samia ricini. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
Daiki Kato, Ken Miura, Kakeru Yokoi. Analysis of the Toll and spaetzle genes involved in Toll path-way-dependent antimicrobial gene induction in the red flour beetle, Tribolium castaneum (Coleoptera: Tenebriodae). BioRxiv. 2022

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Books (10)：

General remarks: Insects and Access and Benefit-Sharing Kakeru Yokoi, Ayako Ishikawa
2024
Chapter7(2)主成分分析(PCA)(RNA-Seqデータ解析 : WETラボのための超鉄板レシピ : ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実)
羊土社 2023 ISBN:9784758122672
Chapter7 サンプル間の類似度を比較する (1)階層クラスタリング(RNA-Seqデータ解析 : WETラボのための超鉄板レシピ : ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実)
羊土社 2023 ISBN:9784758122672
Chapter4 リファレンスゲノムのない生物でde novo解析を行う〜アセンブリからアノテーションまで(RNA-Seqデータ解析 : WETラボのための超鉄板レシピ : ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実)
羊土社 2023 ISBN:9784758122672
ミツバチのゲノム情報解析とその応用
養蜂産業振興会報No.9 p5-9 2023

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Lectures and oral presentations (88)：

昆虫ゲノムデータ解析を始める
(日本昆虫学会第84回大会第68回日本応用動物昆虫学会大会小集会 DNA配列データ解析を始めてみようII 2024)
昆虫遺伝子機能アノテーションをどうするか
(日本昆虫学会第84回大会第68回日本応用動物昆虫学会大会小集会昆虫機能アノテーション:昆虫データ解析に今必要なこと 2024)
はじめに-趣旨説明
(日本昆虫学会第84回大会第68回日本応用動物昆虫学会大会昆虫学におけるABS対応7 ABSの基礎と最新事例 2024)
ゲノム情報解析によるミツバチのダニ抵抗性遺伝子の探索
(ミツバチサミット2023 2023)
I-3. Genome analysis of black soldier fly and its application in breeding
(NIPPON SUISAN GAKKAISHI 2023)

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Education (3)：

2009 - 2012 Nagoya University Graduate School of Bioagricultural Sciences
2007 - 2009 Nagoya University Graduate School of Bioagricultural Sciences
2002 - 2007 Nagoya University School of Agricultural Sciences Department of Biological Resources and Environmental Sciences

Professional career (1)：

Work history (12)：

2021/04 - 現在 National Agriculture and Food Research Organization Institute of Agrobiological Sciences, NARO
2023/04 - 2024/03 山口大学理学部非常勤講師
2021/04 - 2024/03 National Agriculture and Food Research Organization
2019/10 - 2021/03 国立研究開発法人農研機構生物機能利用研究部門・遺伝子利用基盤研究領域・先進昆虫ゲノム改変ユニット主任研究員
2018/10 - 2021/03 National Agriculture and Food Research Organization

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Committee career (4)：

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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