Rchr
J-GLOBAL ID:201601003594812193
Update date: Aug. 18, 2024
Kuramochi Masahiro
クラモチ マサヒロ | Kuramochi Masahiro
Affiliation and department:
Job title:
Assistant Professor
Other affiliations (1):
-
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
Research field (6):
Biological, health, and medical informatics
, Molecular biology
, Quantum beam science
, Nanobioscience
, Mathematical informatics
, Neuroscience - general
Research keywords (10):
結晶構造ダイナミクス
, Antifreeze Protein
, 放射光
, X線
, 1分子計測
, Simulation
, Computational model
, Calcium imaging
, Neural circuit
, C. elegans
Research theme for competitive and other funds (15):
- 2023 - 2026 X線を用いた高速1分子運動解析による膜タンパク質オペランド計測の実現
- 2024 - 2025 機械学習を用いたX線透過動画からの高分子材料の動態物性評価
- 2024 - 2025 先進情報解析を用いた物質動態のX線ブリンキング計測
- 2022 - 2025 凍結低温制御分子の構造特異機能の解明および個体丸ごと保存技術の開発
- 2022 - 2025 筑波大学拠点TRiSTAR「大学×国研×企業の連携によるトップランナー育成プログラム」
- 2022 - 2023 原子スケールの動的特性を検出する微分X線ブリンキング法の開発 ー生体分子から無機・有機・高分子材料までー
- 2022 - 2023 個体生物の細胞内反応場およびタンパク質分子の回転揺らぎピコメートルX線計測
- 2021 - 2023 生体内氷晶のX線ナノスケール観測に基づいた不凍タンパク質多細胞系凍結保存法の確立
- 2020 - 2022 時分割回折X線ブリンキングによるソフトクリスタル動的特性観測
- 2020 - 2022 線虫C.エレガンスにおける凝集タンパク質および分子夾雑場のX線1分子観察
- 2021 - 2022 線虫 C. エレガンスのシナプス伝達実測データに基づく理論モデル構築
- 2019 - 2021 Mechanism of antifreeze proteins for improving the freezing- and cold-tolerance in the nematode Caenorhabditis elegans
- 2020 - 2021 時分割回折X線ブリンキングによる線虫の不凍タンパク質動態の検出
- 2019 - 2020 生きた線虫の1分子動態と細胞応答を同時取得する時分割X線回折/細胞イメージング法
- 2016 - 2018 蛍光生体イメージングと計算機シミュレーションによる線虫神経の時空間活動解析
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Papers (38):
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Daisuke Sasaki, Tatsuya Arai, Yue Yang, Masahiro Kuramochi, Wakako Furuyama, Asuka Nanbo, Hiroshi Sekiguchi, Nobuhiro Morone, Kazuhiro Mio, Yuji C. Sasaki. Micro-second time-resolved X-ray single-molecule internal motions of SARS-CoV-2 spike variants. Biochemistry and Biophysics Reports. 2024. 38. 101712-101712
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Masahiro Kuramochi, Momoka Nakamura, Hiroto Takahashi, Tomoe Komoriya, Teisuke Takita, Ngan Thi Kim Pham, Kiyoshi Yasukawa, Kazuaki Yoshimune. Adenosine triphosphate induces amorphous aggregation of amyloid β by increasing Aβ dynamics. Scientific Reports. 2024. 14. 1
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佐々木 裕次, 倉持 昌弘. タイヤゴム微粒子と高分子のX線観測. Colloid & Interface Communications. 2024. 49. 1
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Yue Yang, Tatsuya Arai, Daisuke Sasaki, Masahiro Kuramochi, Hidetoshi Inagaki, Sumiko Ohashi, Hiroshi Sekiguchi, Kazuhiro Mio, Tai Kubo, Yuji C. Sasaki. Real-time tilting and twisting motions of ligand-bound states of α7 nicotinic acetylcholine receptor. European Biophysics Journal. 2024. 53. 1-2. 15-25
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Yuko Kozono, Masahiro Kuramochi, Yuji C. Sasaki, Haruo Kozono. Ubiquitination of Major Histocompatibility Complex II Changes Its Immunological Recognition Structure. International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24. 23. 17083-17083
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MISC (6):
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丸山迪代, 三村真大, 三村真大, 新木和孝, 井上明俊, 倉持昌弘, 戸井基道, 草田裕之, 冨田峻介, 新海陽一. 細胞内液-液相分離の攪乱とその生体応答. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th
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倉持昌弘. 生きた線虫の1分子動態と細胞応答を同時取得する時分割X線回折/細胞イメージング法. 2021. 34
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Masaki Ishihara, Shoko Fujimura, Kohei Ichiyanagi, Shunsuke Nozawa, Shinichi Adachi, Ryo Fukaya, Masahiro Kuramochi, Hiroshi Sekiguchi, Kazuhiro Mio, Yuji C. Sasaki. Dynamic Internal Motion of GPCR on Live Cells. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2020. 118. 3. 56A-56A
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Sasaki Y. C, Kuramochi M, Sekiguchi H, Mio K. Novel In Vivo Observations of Single Protein Motions Using Laboratory X-Ray Source. Biophysical Journal. 2018. 114. 3. 523A-524A
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Kuramochi Masahiro, Takanashi Chiaki, Sekiguchi Hiroshi, Doi Motomichi, Tsuda Sakae, Sasaki Yuji C. Functional Analysis of Antifreeze Proteins for Cold Tolerance Behavior and X-Ray Single Molecule Observations in C-elegans. Biophysical Journal. 2018. 114. 3. 65A
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Patents (1):
Books (5):
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Acquiring freezing and cold tolerance: The role of structure-specific functions in Ice-Binding Protein molecules
2023
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Ice-Binding Proteins in maintaining biological activity in frozen and sub-zero environments
2023
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氷結合タンパク質は個体生物の凍結・非凍結低温環境における生存率を改善する
2022
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個体生物の凍結・低温耐性を改善する不凍タンパク質の生体内効果
2021
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線虫の凍結・低温耐性を改善する氷結合タンパク質の生体内作用機序の解明
2021
Lectures and oral presentations (152):
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生きた線虫C. elegans細胞内における蛍光タンパク質結晶のX線観察 Dynamical X-ray observation of the crystallized protein in the living Caenorhabditis elegans cells
(2023年度量子ビームサイエンスフェスタ 2024)
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サブテラヘルツ光照射による水和ダイナミクスのX線動態計測と線虫胚発生への非熱作用 Hydration Dynamics and Non-Thermal Effects on the C. elegans Embryogenesis by sub-THz Irradiation
(2023年度量子ビームサイエンスフェスタ 2024)
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薬剤投与に対するアミロイドβのX線動態解析 Dynamic X-ray Observation of Amyloid-β Behaviour Following Drug Administration
(2023年度量子ビームサイエンスフェスタ 2024)
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機械学習を用いたX線透過動画解析による未知動態探索 Searching for unknown dynamics by analysing X-ray transmission videos using machine learning
(2023年度量子ビームサイエンスフェスタ 2024)
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凍結低温制御分子の構造特異機能の解明および個体丸ごと保存技術の開発
(ACT-X「環境とバイオテクノロジー」第5回領域会議 2024)
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Education (3):
- 2014 - 2017 University of Tsukuba
- 2009 - 2011 Ibaraki University Graduate School of Science and Engineering
- 2005 - 2009 Ibaraki University
Professional career (1):
Work history (5):
- 2024/04 - 現在 Ibaraki University
- 2021/05 - 2024/03 Ibaraki University Graduate School of Science and Engineering Assistant Professor
- 2017/04 - 2021/04 The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences
- 2013/09 - 2014/03 National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
- 2011/04 - 2013/08 株式会社ハーディ システムエンジニア
Committee career (4):
- 2024/04 - 現在 Discover Molecules (Springer Nature) Editorial board member
- 2021/05 - 現在 Frontiers in Physiology Review Editor for Invertebrate Physiology
- 2022 - 線虫研究の未来を創る会 オーガナイザー(広報)
- 2021 - 線虫研究の未来を創る会 オーガナイザー(広報)
Awards (9):
- 2024/01 - コニカミノルタ科学技術振興財団 令和5年度 画像科学奨励賞
- 2022/08 - 文科省「世界で活躍できる研究者育成事業」TRiSTARフェロー(筑波大学拠点)
- 2021/10 - 第30回ポリマー材料フォーラム 広報委員会パブリシティ賞 ポスター
- 2019/08 - Future of the Nematode Studies 2019 Next Leader Award
- 2015/12 - DAILAB CAFE-PLUS series 03 Best Presentation Award (runner-up)
- 2014/11 - Best Presentation Award (Graduate Student Session)
- 2011/06 - 日本学生支援機構 大学院第一種奨学金 特に優れた業績による返還免除
- 2011/03 - OIST winning of prize essay
- 2011/01 - 7th Asia Biophysics Association (ABA) Symposium ABA Travel Award
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Association Membership(s) (5):
北米神経科学学会
, THE JAPANESE SOCIETY FOR ARTIFICIAL INTELLIGENCE
, THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
, JAPANESE NEURAL NETWORK SOCIETY
, THE JAPAN NEUROSCIENCE SOCIETY
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