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J-GLOBAL ID：201602209695833109   Reference number：16A0231638

Correction of the Bias Derived from the Number of Exons in Exon-Level Enrichment Analysis

エクソンレベルでのエンリッチメント解析におけるエクソン数に起因するバイアスの補正

Author (2)： HORYU DAISUKE (農業・食品産業技術総合研究機構 中央農業総合研究セ) ,  HAYASHI TAKESHI (農業・食品産業技術総合研究機構 中央農業総合研究セ)
Material： 計量生物学  (Japanese Journal of Biometrics)
Volume： 36  Issue： 2  Page： 63-84  Publication year： Jan. 31, 2016 
JST Material Number： L1096A  ISSN： 0918-4430  Document type： Article
Article type： 原著論文  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： exon ,...

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JST classification (2)： Gene expression  (EC02040Q) ,  Statistics  (AB08000H)

Reference (24)：

• Anders, S., Reyes, A., and Huber, W. (2012). Detecting differential usage of exons from RNA-seq data. Genome Research, 22, 2008-2017.
• Benjamini, Y., and Hochberg, Y. (1995). Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing. Journal of the Royal Statistical Society. Series B, 57, 289-300.
• Bullard, J. H., Purdom, E., Hansen, K. D., and Dudoit, S. (2010). Evaluation of statistical methods for normalization and differential expression in mRNA-Seq experiments. BMC bioinformatics, 11, 94.
• Dillies, M. A., Rau, A., Aubert, J., Hennequet-Antier, C., Jeanmougin, M., Servant, N., Keime, C., Marot, G., Castel, D., Estelle, J., et al. (2013). A comprehensive evaluation of normalization methods for Illumina high-throughput RNA sequencing data analysis. Briefings in bioinformatics, 14, 671-683.
• Dolatshad, H., Pellagatti, A., Fernandez-Mercado, M., Yip, B. H., Malcovati, L., Attwood, M., Przychodzen, B., Sahgal, N., Kanapin, A. A., Lockstone, H., et al. (2015). Disruption of SF3B1 results in deregulated expression and splicing of key genes and pathways in myelodysplastic syndrome hematopoietic stem and progenitor cells. Leukemia, 29, 1092-1103.

Terms in the title (4)： エクソン ,  エンリッチメント解析 ,  起因 ,  バイアス