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J-GLOBAL ID：201602233121467896   Reference number：16A0453768

脊椎動物ゲノム・トランスクリプトームアセンブリ完全度を評価する

Author (1)： HARA YUICHIRO (理研 ライフサイエンス技術基盤研究セ)
Material： バイオサイエンスとインダストリー  (B & I)
Volume： 74  Issue： 3  Page： 228-230  Publication year： May. 10, 2016 
JST Material Number： G0089A  ISSN： 0914-8981  CODEN： BIDSE6  Document type： Article
Article type： 解説  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： *transcriptome ,...
Semi thesaurus term： *gene analysis ,...

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JST classification (2)： Molecular genetics in general  (EC02010J) ,  Evolution theory in general  (EC03010Q)

Reference (4)：

• Parra, G. et al.: Assessing the gene space in draft genomes, Nucleic Acids Res., 37, 289 297 (2009)
• Hara, Y. et al.: Optimizing and benchmarking de novo transcriptome sequencing: from library preparation to assembly evaluation, BMC Genomics, 16, 977 (2015)
• Simão, F. et al.: BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs, Bioinformatics, 31, 3210 3212 (2015)
• 原 雄一郎:どのアセンブリを使うか?:分子系統学的観点に基づくアセンブリの評価,日本進化学会ニュース,17(1), 23~29(2016)

Terms in the title (2)： 脊椎動物 ,  評価