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J-GLOBAL ID:201701007787881810   Update date: Sep. 14, 2024

Matsuo Yoshiyuki

マツオ ヨシユキ | Matsuo Yoshiyuki
Affiliation and department:
Research field  (1): Molecular biology
Research keywords  (7): ナノポアシークエンシング ,  メタゲノム ,  酸化ストレス ,  酸素代謝 ,  酸化還元酵素 ,  小胞体 ,  レドックス
Research theme for competitive and other funds  (16):
  • 2024 - 2027 早産児・低出生体重児における重症感染症関連病原性常在細菌(Pathobiont)の検索
  • 2024 - 2027 精液マイクロバイオーム解析に基づく膿精液症の実態解明と妊孕性に及ぼす影響の検討
  • 2024 - 2027 HTLV-1 感染モデルマウスを用いた腸内細菌投与によるATL発症予防法の開発
  • 2022 - 2025 Dysbiosis of the conjunctival microflora due to repeated antimicrobial eye drops for anti-VEGF antibody intravitreal injection
  • 2022 - 2025 ナノポアシークエンサーによる血中マイクロバイオーム解析に基づく敗血症診断技術開発
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Papers (74):
  • Quynh Thuy Huong Tran, Naoyuki Kondo, Hiroko Ueda, Yoshiyuki Matsuo, Hiroyasu Tsukaguchi. Altered Endoplasmic Reticulum Integrity and Organelle Interactions in Living Cells Expressing INF2 Variants. International Journal of Molecular Sciences. 2024. 25. 18. 9783-9783
  • Quynh Thuy Huong Tran, Naoyuki Kondo, Hiroko Ueda, Yoshiyuki Matsuo, Hiroyasu Tsukaguchi. Endoplasmic Reticulum Alterations in Living Cells Expressing INF2 Variants Causing Glomerulosclerosis and Peripheral Neuropathy. bioRxiv. 2024
  • Eiji Yoshihara, Yoshiyuki Matsuo, So Masaki, Zhe Chen, Hai Tian, Hiroshi Masutani, Akira Yamauchi, Kiichi Hirota, Junji Yodoi. Redoxisome Update: TRX and TXNIP/TBP2-Dependent Regulation of NLRP-1/NLRP-3 Inflammasome. Antioxidants & Redox Signaling. 2024. 40. 10-12. 595-597
  • Atsufumi Ohta, Kenichiro Nishi, Kiichi Hirota, Yoshiyuki Matsuo. Using nanopore sequencing to identify fungi from clinical samples with high phylogenetic resolution. Scientific reports. 2023. 13. 1. 9785-9785
  • Atsufumi Ohta, Kenichiro Nishi, Kiichi Hirota, Yoshiyuki Matsuo. DNA metabarcoding workflow utilizing nanopore long-read sequencing and consensus generation for rapid identification of fungal taxa with high phylogenetic resolution. bioRxiv. 2023
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MISC (4):
  • Yoshiyuki Matsuo. Nanopore amplicon sequencing. protocols.io. 2022
  • Yoshiyuki Matsuo. DNA extraction from fecal samples. protocols.io. 2022
  • Yoshiyuki Matsuo. Preparation of cigarette smoke extract (CSE). protocols.io. 2021
  • 甲斐 慎一, 松尾 禎之, 松川 志乃, 岩井 鉄平, 中川 草, Kryukov Kirill, 今西 規, 広田 喜一. MinIONを用いた迅速細菌同定システムの臨床応用への取り組み. 日本集中治療医学会雑誌. 2019. 26. Suppl. [O145-4]
Books (12):
  • Nanopore sequencing : methods and protocols, Methods in Molecular Biology
    Humana Press 2023 ISBN:9781071629956
  • 実験医学増刊 バイオDBとウェブツール : ラボで使える最新70選 : 知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤
    羊土社 2022 ISBN:9784758104067
  • 実験医学別冊 メタゲノムデータ解析 : 16Sも!ショットガンも!ロングリードも!菌叢解析が得意になる凄技レシピ
    羊土社 2021 ISBN:9784758122559
  • 実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ 「ロングリード WET&DRY 解析ガイド」
    羊土社 2021 ISBN:9784758122535
  • INTENSIVIST 11巻2号 特集 重症感染症2
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2019
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Lectures and oral presentations  (99):
  • ナノポアシークエンサーを用いたアンプリコン解析の基礎と実践
    (オックスフォード・ナノポアテクノロジーズwebセミナー 2024)
  • ロングリードシークエンシング技術を活用した高精度真菌同定ワークフローの開発
    (第46回 日本分子生物学会年会 2023)
  • Long-read DNA metabarcoding for high-resolution microbial community profiling
    (2023)
  • 転写因子HIFの活性化はラット初代培養肝細胞におけるIL-1誘発のNO産生を抑制する
    (第78回 日本消化器外科学会 2023)
  • Lung and Skin/Mucosal Barrier via thioredoxin System
    (International Meet on Cell Science and Molecular Biology (CSMBMEET 2023) 2022)
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Professional career (1):
  • 博士(医学) (京都大学)
Awards (1):
  • 2018 - 一般財団法人加多乃会 第36回研究助成加多乃賞 炎症が惹起する細胞内代謝転換における酸化還元(レドックス)シグナルの関与の検討
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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