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J-GLOBAL ID:201701010480860973
Update date: Sep. 25, 2024
Nakamura Akihiko
ナカムラ アキヒコ | Nakamura Akihiko
Affiliation and department:
Job title:
Associate Professor
Homepage URL (1):
https://wwp.shizuoka.ac.jp/funcbiomol/
Research field (6):
Biophysics
, Nanobioscience
, Bio-, chemical, and soft-matter physics
, Wood science
, Landscape science
, Environmental agriculture
Research keywords (5):
糖質関連酵素
, Enzyme kinetics
, 1分子計測
, 結晶構造解析
, プラスチック分解酵素
Research theme for competitive and other funds (11):
- 2024 - 2027 天然結晶分解酵素を模倣した結晶性プラスチック分解酵素システムの開発
- 2022 - 2026 プラスチックを探して壊すバイオマイクロドローンの創出
- 2021 - 2024 自然界に学ぶ「バイオマス分解機構」の解明
- 2019 - 2022 Single molecule analysis of carbohydrate degrading enzyme with double binding domains form marine bacterium
- 2018 - 2019 独立に進化した動物•植物•微生物の糖質消化システムを 分子機能構造から読み解く
- 2017 - 2019 高速高精度一分子観察による結晶性糖質分解機構の解明
- 2017 - 2019 高時空間分解能一分子観察と理論解析を組み合わせた分子モーター運動解析法の開発
- 2015 - 2017 セルロース分解酵素のモーター運動に寄与する構造要素の解明
- 2015 - 2016 省エネルギーリニアモーターの運動性を決める構 造的要素の解明
- 2013 - 2015 ダブルドメインセルラーゼの吸着バランス制御による結晶性多糖構造分解反応の促進
- ベイズ推定を用いた生体分子モーターの動作メカニズムの解明: 一分子実験と分子シミュレーションの橋渡し
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Papers (46):
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Yui Ogura, Yoshihito Hashino, Akihiko Nakamura. Direct Screening of PET Hydrolase Activity in Culture Medium Based on Turbidity Reduction. ACS Omega. 2024
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Toshio Mori, Sayaka Sugimoto, Syouma Ishii, Jing Wu, Akihiko Nakamura, Hideo Dohra, Kaoru Nagai, Hirokazu Kawagishi, Hirofumi Hirai. Biotransformation and detoxification of tetrabromobisphenol A by white-rot fungus Phanerochaete sordida YK-624. Journal of Hazardous Materials. 2024
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Yoshiko Tanaka, Takayuki Uchihashi, Akihiko Nakamura. Product inhibition slow down the moving velocity of processive chitinase and sliding-intermediate state blocks re-binding of product. Archives of Biochemistry and Biophysics. 2024
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Taku Uchiyama, Takayuki Uchihashi, Takuya Ishida, Akihiko Nakamura, Josh V. Vermaas, Michael F. Crowley, Masahiro Samejima, Gregg T. Beckham, Kiyohiko Igarashi. Lytic polysaccharide monooxygenase increases cellobiohydrolases activity by promoting decrystallization of cellulose surface. Science Advances. 2022
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Akihiko Nakamura, Naoya Kobayashi, Nobuyasu Koga, Ryota Iino. Positive Charge Introduction on the Surface of Thermostabilized PET Hydrolase Facilitates PET Binding and Degradation. ACS Catalysis. 2021. 8550-8564
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MISC (22):
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中村彰彦, 石渡大貴, VISOOTSAT Akasit, 内山拓, 水谷健二, 金子哲, 村田武士, 五十嵐圭日子, 飯野亮太, 飯野亮太. バクテリア及びカビ由来GH6セロビオヒドロラーゼのドメイン機能の違い. 応用糖質科学. 2020. 10. 4
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安藤潤, 安藤潤, 中村彰彦, 中村彰彦, VISOOTSAT Akasit, 山本真由子, SONG Chihong, 村田和義, 飯野亮太, 飯野亮太. 金ナノ粒子を用いた生体分子モーターの高速・高精度1分子イメージング. 応用物理学会春季学術講演会講演予稿集(CD-ROM). 2019. 66th. ROMBUNNO.9a-W641-11-659
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Ryota Iino, Akihiko Nakamura. One- Nanometer Steps in the Motion of a Linear Molecular Motor Serratia marcescens Chitinase A Resolved by Gold Nanoprobe. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2017. 112. 3. 582A-582A
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内山 拓, 内橋 貴之, 金子 哲, 中村 彰彦, 五十嵐 圭日子, 鮫島 正浩. セルロース資化性放線菌Cellulomonas fimi由来セルラーゼのプロセッシビティを中心とした機能解析. 応用糖質科学. 2016. 6. 3. 58-58
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中村彰彦, 石田卓也, 日下勝弘, 田中伊知郎, 新村信雄, 鮫島正浩, 五十嵐圭日子. 中性子/X線結晶構造解析によるセルラーゼのプロトン伝達経路と反応機構の解明. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2016. 16th
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Books (1):
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きのこの生物活性と応用展開
シーエムシー出版 2021 ISBN:9784781316222
Lectures and oral presentations (31):
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Development and single-molecule binding-analysis of plastic hydrolase enzyme for recycling
(MRM2023/IUMRS ICA2023 Symposium E-1 Precise Material Science for Degradation and Stability 2023)
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Improvement of activity and thermostability of a PET hydrolase
(16th Eurasia Conference on Chemical Sciences 2023 Frontiers in Chemical Sciences for Sustainability 2023)
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Development of polyethylene terephthalate binding protein using the chitin-binding domein from Pyrococcus furiosus by phage display method
(International Conference for Green Science and Technology 2023)
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Development and Characterization of Highly Heat Tolerant and Active Plastic Degrading Enzymes
(International Conference for Green Science and Technology 2023)
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脊椎動物由来ヒアルロン酸分解酵素PH20の酵母発現系の構築と酵素特性解析
(日本応用糖質科学会中部支部富山講演会 2023)
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Education (5):
- 2011 - 2014 東京大学大学院 農学生命科学研究科 生物材料科学専攻 博士課程
- 2009 - 2011 東京大学大学院 農学生命科学研究科 生物材料科学専攻 修士課程
- 2007 - 2009 The University of Tokyo
- 2005 - 2007 The University of Tokyo College of Arts and Sciences
- 2001 - 2004 栃木県立 栃木高校
Professional career (1):
- 博士(農学) (東京大学大学院 農学生命科学研究科)
Work history (6):
Committee career (5):
- 2023/04 - 現在 公益財団法人セイコーインスツル新世代研究財団 バイオ単分子研究会 委員
- 2021/04 - 現在 公益財団法人 新世代研究所 バイオ単分子研究会 委員
- 2023/12 - 2023/12 国立研究開発法人海洋研究開発機構 講演者
- 2019/04 - 2021/03 公益財団法人 新世代研究所 水和ナノ研究会 委員
- 2019/04 - 2021/03 日本生物物理学会 中部支部会 会計
Awards (5):
- 2021/07 - The Biophysical Society of Japan Biophysics and Physicobiology Editors' Choice Award (2021)
- 2019/09 - 日本生物物理学会 若手奨励賞 結晶性キチン加水分解酵素は背水の陣で進むブラウニアンモーターである
- 2019/05 - 新世代研究所 ATI研究奨励賞
- 2016/12 - 日本中性子科学会 波紋President Choice (論文賞) 中性子/X線結晶構造解析によって明らかとなった反転型セルロース加水分解酵素のプロトン伝達経路を含んだ反応機構
- 2015/10 - Guinness World Records Highest Resolution X-ray Crystallography Image of an Enzyme
Association Membership(s) (4):
セルラーゼ研究会
, THE JAPANESE SOCIETY FOR NEUTRON SCIENCE
, THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
, THE JAPANESE SOCIETY OF APPLIED GLYCOSCIENCE
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