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J-GLOBAL ID：201701011471488391   Update date: Oct. 14, 2024

Mori Yoshiharu

モリ ヨシハル | Mori Yoshiharu
Affiliation and department：
Keio University Graduate School of Science and Technology

About Keio University Graduate School of Science and Technology


Homepage URL  (1)： https://quantum.keio.ac.jp/
Research field  (3)： Biological, health, and medical informatics ,  Bio-, chemical, and soft-matter physics ,  Biophysics
Research keywords  (5)： 量子コンピューティング ,  バイオインフォマティクス ,  タンパク質 ,  分子シミュレーション ,  生物物理
Research theme for competitive and other funds  (4)：
  • 2021 - 2025 Molecular mechanism of the accurate protein synthesis of the ribosome in translation
  • 2019 - 2020 マルチスケール分子シミュレーションによる受容体チロシンキナーゼの構造モデリング
  • 2016 - 2019 タンパク質合成におけるアミノ酸の高精度選択機構の解明
  • 2011 - 2013 ATP合成におけるタンパク質触媒機構の理論的研究
Papers (23)：
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MISC (9)：
  • 森 義治. リボソーム小サブユニットにおける開始tRNA安定化の分子機構. アンサンブル. 2024. 26. 269-275
  • Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Stabilization Mechanism of Initiator Transfer RNA in the Small Ribosomal Subunit from Coarse-Grained Molecular Simulations. 2024
  • Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Navigating Ultra-Large Virtual Chemical Spaces with Product-of-Experts Chemical Language Models. 2024
  • Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Anesthetic-binding induced motion of GABA A receptors revealed by coarse-grained molecular dynamics simulations. bioRxiv. 2023
  • Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. End-to-end protein-ligand complex structure generation with diffusion-based generative models. bioRxiv. 2022
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Books (3)：
  • Enhanced sampling algorithms
    2013
  • Generalized isobaric-isothermal ensemble algorithms
    From Computational Biophysics to Systems Biology, John von Neumann Institute for Computing, 139-144 2012
  • Generalized-ensemble simulations in protein science
    Proceedings of the 4th Japan-Russia International Workshop MSSMBS'10, Nova Science, 46-60 2011
Lectures and oral presentations  (139)：
  • 量子アルゴリズムを利用したタンパク質フォールディングモデルのモンテカルロシミュレーション
    (第38回分子シミュレーション討論会 2024)
  • 量子化学計算に基づくIL-10と受容体のPPIにおけるホットスポット定量的予測
    (第74回日本薬学会関西支部大会 2024)
  • Exploring synthetically accessible chemical spaces with product-of-expert chemical language models
    (CBI学会2024年大会 2024)
  • AlphaFold2により作成したヒト嗅覚受容体に対する網羅的ドッキングシミュレーションを用いた匂い予測
    (日本味と匂学会第58回大会 2024)
  • 量子・古典ハイブリッドアルゴリズムによる二重井戸型ポテンシャルにおける効率的モンテカルロシミュレーション
    (日本物理学会第79回年次大会 2024)
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Education (3)：
  • 2009 - 2011 名古屋大学大学院 理学研究科 物質理学専攻(物理系) 博士課程(後期課程)
  • 2007 - 2009 名古屋大学大学院 理学研究科 物質理学専攻(物理系) 博士課程(前期課程)
  • 2003 - 2007 Nagoya University School of Science Department of Physics
Professional career (1)：
  • 博士(理学) (名古屋大学)
Work history (7)：
  • 2023/10 - 現在 Keio University Graduate School of Science and Technology
  • 2023/10 - 現在 Kobe University Graduate School of System Informatics
  • 2020/04 - 2023/09 Kobe University Graduate School of System Informatics
  • 2017/04 - 2020/03 Kitasato University School of Pharmaceutical Sciences
  • 2012/05 - 2017/03 Institute for Molecular Science Department of Theoretical and Computational Molecular Science
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Awards (3)：
  • 2021/10 - CBI学会2021年大会 口頭発表賞
  • 2011/03 - 名古屋大学 学術奨励賞
  • 2009/12 - 第23回分子シミュレーション討論会 学生優秀発表賞 「レプリカ交換分子動力学法における適切なスケーリング法」
Association Membership(s) (11)：
THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN ,  THE CHEM-BIO INFORMATICS SOCIETY ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN ,  JAPAN SOCIETY FOR MOLECULAR SCIENCE ,  THE MOLECULAR SIMULATION SOCIETY OF JAPAN ,  PROTEIN SCIENCE SOCIETY OF JAPAN ,  THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN ,  情報処理学会 ,  量子生命科学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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