Art

J-GLOBAL ID：201702211718108433   Reference number：17A1769431

Methods for analyzing next-generation sequencing data XI. Galaxy-an integrated data analysis environment

次世代シーケンサーデータの解析手法 第11回 統合データ解析環境Galaxy

Author (4)： OTA TATSURO (情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセ) ,  TERADA TOMOKO (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SHIMIZU KENTARO (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  KADOTA KOJI (東大 大学院農学生命科学研究科)
Material： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
Volume： 28  Issue： 3  Page： 167-175  Publication year： Nov. 10, 2017 
JST Material Number： L3534A  ISSN： 1343-327X  Document type： Article
Article type： 解説  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： automatic analyser ,...
Semi thesaurus term： *Galaxy ,...

Register(free) or Log In to access     To see more with JDream III (charged).   {{ this.onShowAbsJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=17A1769431&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=L3534A") }}

JST classification (2)： Computer utilization technology in general  (JE01000C) ,  Structure and chemistry of genes  (EC02020U)

Reference (25)：

• 1) Field D, Tiwari B, Booth T, Houten S, Swan D, et al. (2006) Open software for biologists: from famine to feast. Nat Biotechnol 24: 801-803.
• 2) Giardine B, Riemer C, Hardison RC, Burhans R, Elnitski L, et al. (2005) Galaxy: a platform for interactive large-scale genome analysis. Genome Res 15: 1451-1455.
• 3) Blankenberg D, Gordon A, Von Kuster G, Coraor N, Taylor J, et al. (2010) Manipulation of FASTQ data with Galaxy. Bioinformatics 26: 1783-1785.
• 4) Goecks J, Nekrutenko A, Taylor J; Galaxy Team. (2010) Galaxy: a comprehensive approach for supporting accessible, reproducible, and transparent computational research in the life sciences. Genome Biol 11: 128.
• 5) Afgan E, Baker D, van den Beek M, Blankenberg D, Bouvier D, et al. (2016) The Galaxy platform for accessible, reproducible and collaborative biomedical analyses: 2016 update. Nucleic Acids Res 44: W3-W10.

Terms in the title (5)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  統合 ,  データ解析 ,  環境