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J-GLOBAL ID：201702213929539746   Reference number：17A0483931

画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備 第2章 高次解析システムの整備 2 ゲノム情報を活用した新規遺伝子予測機能(1)予測基礎プログラム構築

Author (3)： ITO TSUYOSHI (農業生物資源研) ,  NUMA HISATAKA (農業生物資源研) ,  TANAKA TSUYOSHI (農業生物資源研)
Material： 農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果  (農林水産技術会議事務局研究成果)
Issue： 570  Page： 19-21  Publication year： Mar. 31, 2017 
JST Material Number： S0070A  Document type： Article
Article type： 原著論文  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： crop (agriculture) ,  *livestock product ,  genetic information ,  *database ,  plan ,  Genome-Wide Association Study ,  single nucleotide polymorphism ,  Regression Analysis ,  Mutation ,  *forecast ,  *agricultural products ,  genome information ,  de novo mutation
Semi thesaurus term： program ,  Genome-Wide Association Study ,  SNP ,  de novo mutation

JST classification (2)： System design and analysis  (IA02030D) ,  Documentation  (FA01020I)

Reference (8)：

• Pindel. http://gmt.genome.wustl.edu/packages/pindel/ ( 参照日: 2016.7.11).
• CNVnator: a tool for CNV discovery and genotyping from depth-of-coverage by mapped reads. https://github.com/abyzovlab/CNVnator (参照日 : 2016.7.11).
• Genome STRiP. http://www.broadinstitute.org/software/genomestrip/ (参照日 : 2016.7. 11).
• Short Oligonucleotide Analysis Package. http://soap.genomics.org.cn/soapindel.html (参照日 : 2016.7.11).
• TASSEL. http://www.maizegenetics.net/tassel (参照日 : 2016.7.11).

Terms in the title (11)： 畜産物 ,  ゲノム ,  情報データベース ,  整備 ,  解析システム ,  ゲノム情報 ,  活用 ,  遺伝子 ,  予測 ,  基礎 ,  構築