Pat
J-GLOBAL ID：201703005881741695
ミドリイシ属サンゴのための種間及び種内マイクロサテライトマーカー
Inventor：
,
,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：
特許業務法人 津国
Gazette classification：公表公報
Application number (International application number)：2016561384
Publication number (International publication number)：2017520235
Application date： Apr. 10, 2015
Publication date： Jul. 27, 2017
Summary：
ミドリイシ属の対象をミドリイシ種と同定するための方法は、対象のゲノムにおける1つ以上のマイクロサテライト座位を検出する工程を含み、ここで、該マイクロサテライト座位は、マイクロサテライト座位8346m3及びその他からなる群より選択される。第一のサンゴコロニーと同じ種に属する回復が必要とされる第二のサンゴコロニーに、ミドリイシ種の第一のミドリイシサンゴコロニーを移植することによって回復させたサンゴコロニーのキメラ化レベルの指数を定量するための方法は、鋳型として第一のサンゴコロニーから得られたゲノムDNAを用いて増幅したPCRフラグメントサイズが、第二のサンゴコロニーから得られたゲノムDNAを用いて増幅したPCRフラグメントサイズとは異なる、1つ以上のマイクロサテライト座位を同定する工程を含む。
Claim (excerpt)：
対象のゲノムにおいて1つ以上のマイクロサテライト座位を検出する工程を含む、対象をミドリイシ属と同定するための方法であって、該マイクロサテライト座位は、
(i)マイクロサテライト座位8346m3(その5’フランキング領域は配列番号1のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号2に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(ii)マイクロサテライト座位7961m4(その5’フランキング領域は配列番号3のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号4に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(iii)マイクロサテライト座位11745m3(その5’フランキング領域は配列番号5のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号6に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(iv)マイクロサテライト座位12406m3(その5’フランキング領域は配列番号7のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号8に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(v)マイクロサテライト座位11543m5(その5’フランキング領域は配列番号9のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号10に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(vi)マイクロサテライト座位530m4(その5’フランキング領域は配列番号11のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号12に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(vii)マイクロサテライト座位11401m4(その5’フランキング領域は配列番号13のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号14に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(viii)マイクロサテライト座位441m6(その5’フランキング領域は配列番号15のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号16に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(ix)マイクロサテライト座位11292m4(その5’フランキング領域は配列番号17のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号18に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(x)マイクロサテライト座位8499m4(その5’フランキング領域は配列番号19のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号20に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(xi)マイクロサテライト座位7203m5(その5’フランキング領域は配列番号21のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号22に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(xii)マイクロサテライト座位10366m5(その5’フランキング領域は配列番号23のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号24に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(xiii)マイクロサテライト座位12130m5(その5’フランキング領域は配列番号25のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号26に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(xiv)マイクロサテライト座位4546m2(その5’フランキング領域は配列番号27のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号28に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(xv)マイクロサテライト座位9079m3(その5’フランキング領域は配列番号29のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号30に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(xvi)マイクロサテライト座位11192m4(その5’フランキング領域は配列番号31のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号32に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(xvii)マイクロサテライト座位8010m6(その5’フランキング領域は配列番号33のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号34に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);
(xviii)マイクロサテライト座位12198m3(その5’フランキング領域は配列番号35のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号36に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);及び
(xix)マイクロサテライト座位7850m4(その5’フランキング領域は配列番号37のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号38に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む)
からなる群より選択される、前記方法。
IPC (2)：
FI (2)：
F-Term (18)：
4B063QA01
, 4B063QA05
, 4B063QA08
, 4B063QA13
, 4B063QA18
, 4B063QA20
, 4B063QQ02
, 4B063QQ08
, 4B063QQ42
, 4B063QQ52
, 4B063QR32
, 4B063QR35
, 4B063QR55
, 4B063QR62
, 4B063QS25
, 4B063QS32
, 4B063QX01
, 4B063QX02
Cited by examiner (5)
-
Plankton & Benthos Rsearch, 2009, Vol.4, No.1, p.38-41
-
Ecology and Evolution, 2012, Vol.2, No.8, p.1867-1888
-
Molecular Ecology Resources, 2008, Vol.8, p.587-589
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