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J-GLOBAL ID:201703005881741695

ミドリイシ属サンゴのための種間及び種内マイクロサテライトマーカー

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 特許業務法人 津国
Gazette classification:公表公報
Application number (International application number):2016561384
Publication number (International publication number):2017520235
Application date: Apr. 10, 2015
Publication date: Jul. 27, 2017
Summary:
ミドリイシ属の対象をミドリイシ種と同定するための方法は、対象のゲノムにおける1つ以上のマイクロサテライト座位を検出する工程を含み、ここで、該マイクロサテライト座位は、マイクロサテライト座位8346m3及びその他からなる群より選択される。第一のサンゴコロニーと同じ種に属する回復が必要とされる第二のサンゴコロニーに、ミドリイシ種の第一のミドリイシサンゴコロニーを移植することによって回復させたサンゴコロニーのキメラ化レベルの指数を定量するための方法は、鋳型として第一のサンゴコロニーから得られたゲノムDNAを用いて増幅したPCRフラグメントサイズが、第二のサンゴコロニーから得られたゲノムDNAを用いて増幅したPCRフラグメントサイズとは異なる、1つ以上のマイクロサテライト座位を同定する工程を含む。
Claim (excerpt):
対象のゲノムにおいて1つ以上のマイクロサテライト座位を検出する工程を含む、対象をミドリイシ属と同定するための方法であって、該マイクロサテライト座位は、 (i)マイクロサテライト座位8346m3(その5’フランキング領域は配列番号1のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号2に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (ii)マイクロサテライト座位7961m4(その5’フランキング領域は配列番号3のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号4に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (iii)マイクロサテライト座位11745m3(その5’フランキング領域は配列番号5のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号6に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (iv)マイクロサテライト座位12406m3(その5’フランキング領域は配列番号7のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号8に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (v)マイクロサテライト座位11543m5(その5’フランキング領域は配列番号9のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号10に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (vi)マイクロサテライト座位530m4(その5’フランキング領域は配列番号11のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号12に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (vii)マイクロサテライト座位11401m4(その5’フランキング領域は配列番号13のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号14に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (viii)マイクロサテライト座位441m6(その5’フランキング領域は配列番号15のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号16に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (ix)マイクロサテライト座位11292m4(その5’フランキング領域は配列番号17のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号18に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (x)マイクロサテライト座位8499m4(その5’フランキング領域は配列番号19のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号20に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (xi)マイクロサテライト座位7203m5(その5’フランキング領域は配列番号21のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号22に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (xii)マイクロサテライト座位10366m5(その5’フランキング領域は配列番号23のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号24に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (xiii)マイクロサテライト座位12130m5(その5’フランキング領域は配列番号25のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号26に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (xiv)マイクロサテライト座位4546m2(その5’フランキング領域は配列番号27のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号28に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (xv)マイクロサテライト座位9079m3(その5’フランキング領域は配列番号29のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号30に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (xvi)マイクロサテライト座位11192m4(その5’フランキング領域は配列番号31のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号32に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (xvii)マイクロサテライト座位8010m6(その5’フランキング領域は配列番号33のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号34に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む); (xviii)マイクロサテライト座位12198m3(その5’フランキング領域は配列番号35のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号36に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む);及び (xix)マイクロサテライト座位7850m4(その5’フランキング領域は配列番号37のヌクレオチド配列を含み、その3’フランキング領域は配列番号38に対して相補的であるヌクレオチド配列を含む) からなる群より選択される、前記方法。
IPC (2):
C12N 15/09 ,  C12Q 1/68
FI (2):
C12N15/00 A ,  C12Q1/68 A
F-Term (18):
4B063QA01 ,  4B063QA05 ,  4B063QA08 ,  4B063QA13 ,  4B063QA18 ,  4B063QA20 ,  4B063QQ02 ,  4B063QQ08 ,  4B063QQ42 ,  4B063QQ52 ,  4B063QR32 ,  4B063QR35 ,  4B063QR55 ,  4B063QR62 ,  4B063QS25 ,  4B063QS32 ,  4B063QX01 ,  4B063QX02
Article cited by the Patent:
Cited by applicant (5)
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Cited by examiner (6)
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