アシネトバクター属菌の遺伝子型タイピング法及びこれに用いるプライマーセット

Inventor： ,
Applicant, Patent owner： ,
Agent (1)：特許業務法人特許事務所サイクス
Gazette classification：特許公報
Application number (International application number)：2014061751
Publication number (International publication number)：2014207895
Patent number：6160015
Application date： Mar. 25, 2014
Publication date： Nov. 06, 2014
Claim (excerpt)：

【請求項1】アシネトバクター属菌の染色体上の、 (1)Acinetobacter pittii特異的オープンリーディングフレーム(ORF) (2)Acinetobacter nosocomialis特異的ORF (3)Acinetobacter species close to nosocomialis特異的ORF (4)genomic isletを構成するORF、および (5)genomic islandを構成するORF、の有無を任意の順で検出し、これらORFの有無の組み合わせにより遺伝子型別分類を行うステップを含む、アシネトバクター属菌の菌種同定、クローン同定法および/又は菌株識別のための方法であって、前記(1)のORFにおける遺伝子が配列表の配列番号1の遺伝子であり、前記(2)のORFにおける遺伝子が配列表の配列番号2の遺伝子であり、前記(3)のORFにおける遺伝子が配列表の配列番号3の遺伝子であり、前記(4)のORFにおけるgenomic isletが、AB57_0815、AB57_3308、ACICU_02966、ACICU_03137、AB57_2484、ACICU_02042、ACICU_01870、AB57_0388、AB57_0454、AB57_0526、AB57_1914、AB57_1987、AB57_2085、AB57_2850、AB57_2930、AB57_3624、ACICU_00180、ACICU_00563、ACICU_02520、ACICU_02597、ACICU_02468、ACICU_02886、ACICU_03379、ACICU_03418、ACICU_03581およびA1S_3257からなる群より選ばれる少なくとも4種の遺伝子であり、前記(5)のORFにおけるgenomic islandがABTJ_03567からABTJ_03571、ABTJ_01331からABTJ_01338、ABTJ_02589からABTJ_02595、ACICU_00873からACICU_00880、AB57_0290、ABZJ_00241 からABZJ_00248、ABTJ_02688 からBTJ_02691、ACICU_00228、AB57_0959からAB57_0970、ABTJ_00965 からABTJ_00971、ACICU_02206からACICU_02209、blaTEMからなる群より選ばれる少なくとも4種の遺伝子である方法。

IPC (2)：

C12Q 1/68 ( 200 6.01) , C12N 15/09 ( 200 6.01)

FI (2)：

C12Q 1/68 ZNA A , C12N 15/00 A

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

黄色ブドウ球菌の遺伝子型別分類法およびこれに用いるプライマーセット
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2009-281486 Applicant：愛知県
緑膿菌の遺伝子型別分類法およびこれに用いるプライマーセット
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2012-010593 Applicant：愛知県, 学校法人金沢医科大学

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (7)

細菌検査室で実施可能なAcinetbacter baumannii国際流行株の識別法の開発と臨床応用
VRE、MDRP等の伝播様式と蔓延防止に関する研究
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 201009, Vol. 54, No. 9, p. 3569-3577

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