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J-GLOBAL ID：201703012063993081

核酸、プライマーセットおよびこれを用いたカンジダタス・リベリバクター・ソラナケアルムの検出方法

Inventor：
藤川 貴史

About 藤川 貴史


Applicant, Patent owner：
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

About 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構


Agent (2)： 相原 礼路 ,  森脇 理生
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2015159251
Publication number (International publication number)：2017035048
Application date： Aug. 11, 2015
Publication date： Feb. 16, 2017
Summary：
【課題】 植物病原細菌であるカンジダタス・リベリバクター・ソラナケアルム(Lso)をより特異的に検出することができる核酸、プライマーセットおよび検出方法を提供する。【解決手段】 本発明者らは、上記課題を解決するために、LsoDNAを特異的に検出するプライマーの設計を新規に行い、Lsoおよび類縁のLiberibacter属細菌を含む約60種もの細菌の16S rDNA配列を抽出してアラインメント解析を行い、Lso特有の塩基を見出し、塩基長、GC含量およびTm値を考慮し、Lsoに特異的なプライマーとして利用可能な塩基配列を抽出した。【選択図】 図1
Claim (excerpt)：
配列番号1で表される塩基配列に含まれる連続した16〜30塩基からなる塩基配列またはその相補配列からなり、 配列番号1の塩基番号66、166、167、168、169、170、197、198、199、200、201、230、231、249、250、251、431、432、444、535、545、546、547、548、592、593、594、595、596、606、607、608、609、648、792、793、820、821、822、823、944、945、946、947、986、987、988、989、990、1063、1064、1065、1087、1088、1089、1090、1091、1092、1093、1094、1095、1096、1214、1215、1252、1253、1254、1255および1256からなる群より選択される少なくとも1つの塩基を含む、核酸。
IPC (2)：
C12N 15/09 ,  C12Q 1/68
FI (2)：
C12N15/00 A ,  C12Q1/68 A
F-Term (22)：
4B024AA11 ,  4B024CA01 ,  4B024HA08 ,  4B024HA12 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ04 ,  4B063QQ06 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR08 ,  4B063QR32 ,  4B063QR42 ,  4B063QR50 ,  4B063QR55 ,  4B063QR62 ,  4B063QR73 ,  4B063QR78 ,  4B063QS25 ,  4B063QS28 ,  4B063QS34 ,  4B063QS36 ,  4B063QX01
Article cited by the Patent：
Cited by examiner (5)
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