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J-GLOBAL ID:201801000309338080
Update date: Jul. 16, 2024
Iwakiri Junichi
Iwakiri Junichi
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Affiliation and department:
The University of Tokyo Graduate School of Frontier Sciences
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Detailed information
Homepage URL (1):
https://sites.google.com/view/iwakiri
Research field (2):
Systems genomics
, Biological, health, and medical informatics
Research keywords (7):
長鎖ノンコーディングRNA
, RNA修飾
, RNA-RNA相互作用
, RNA-タンパク質相互作用
, RNA結合タンパク質
, バイオインフォマティクス
, ノンコーディングRNA
Research theme for competitive and other funds (3):
2020 - 2023 アーカイブデータの大規模解析による長鎖非コードRNA機能解析のための情報基盤構築
2017 - 2020 RNA-クロマチン相互作用予測と応用
2016 - 2019 lncRNAを中心とした生体分子間相互作用ネットワークの予測と機能推定法の開発
Papers (27):
Tsukasa Fukunaga, Junichi Iwakiri, Michiaki Hamada. Web Services for RNA-RNA Interaction Prediction. Methods in Molecular Biology. 2023. 2586. 2586. 175-195
Junichi Iwakiri, Kumiko Tanaka, Takeshi Chujo, Hiro Takakuwa, Tomohiro Yamazaki, Goro Terai, Kiyoshi Asai, Tetsuro Hirose. Remarkable improvement in detection of readthrough downstream-of-gene transcripts by semi-extractable RNA-sequencing. RNA. 2022. 29. 2. 170-177
Satoru Shinriki, Mayumi Hirayama, Akiko Nagamachi, Akihiko Yokoyama, Takeshi Kawamura, Akinori Kanai, Hidehiko Kawai, Junichi Iwakiri, Rin Liu, Manabu Maeshiro, et al. DDX41 coordinates RNA splicing and transcriptional elongation to prevent DNA replication stress in hematopoietic cells. Leukemia. 2022. 36. 11. 2605-2620
Non-coding RNA research accelerated by large-scale sequence data. JSBi Bioinformatics Review. 2022. 3. 1. 1-10
Shun Sakuraba, Qilin Xie, Kota Kasahara, Junichi Iwakiri, Hidetoshi Kono. Extended ensemble simulations of a SARS-CoV-2 nsp1-5’-UTR complex. PLOS Computational Biology. 2022. 18. 1. e1009804-e1009804
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MISC (12):
黒木 花菜子, 高尾 大輔, 知念 拓実, 豊田 敦, 寺井 悟朗, 岩切 淳一, 浅井 潔, 北川 大樹. ゲノムワイドCRISPRスクリーニングによる一次繊毛解体・細胞周期再エントリー制御因子の同定. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2019. 92回. [2P-375]
二宮賢介, ALY Mahmoud Khamis, 坂口裕理子, 足達俊吾, 夏目徹, 岩切淳一, 寺井悟朗, 浅井潔, 鈴木勉, 廣瀬哲郎. 核内ストレス体による2つのスプライシング制御機構. 日本RNA学会年会要旨集. 2019. 21st
二宮賢介, ALY Mahmoud Khamis, 坂口裕理子, 足達俊吾, 夏目徹, 岩切淳一, 寺井悟朗, 浅井潔, 鈴木勉, 廣瀬哲郎. HSATIII lncRNAによる2つのスプライシング制御機構. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2019. 42nd
二宮賢介, 足達俊吾, 夏目徹, 岩切淳一, 寺井悟朗, 浅井潔, 廣瀬哲郎. 核内ストレス体によるストレス回復期のスプライシング制御. 日本RNA学会年会要旨集. 2018. 20th. 94
二宮賢介, 足達俊吾, 夏目徹, 岩切淳一, 寺井悟朗, 浅井潔, 廣瀬哲郎. 核内ストレス体によるストレス回復期のスプライシング制御. RNAフロンティアミーティング, 2018. 2018
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Books (3):
RNA Structure Prediction
Springer Nature (Humana New York) 2023 ISBN:9781071627679
バイオインフォマティクスのための生命科学入門
コロナ社 2022 ISBN:9784339027310
Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology
Elsevier 2018
Professional career (1):
博士(医学)
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