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J-GLOBAL ID：201801000962157848
Update date: Oct. 03, 2024
Masao Nagasaki
ナガサキ マサオ | Masao Nagasaki
Affiliation and department：
Job title：
Professor
Homepage URL (1)：
http://nagasakilab.csml.org/
Research field (1)：
Genomics
Research keywords (3)：
Large scale data analysis
, Biomedical Informatics
, Bioinformatics
Research theme for competitive and other funds (19)：
- 2023 - 2026 空間マルチオミクス解析による急性冠症候群の発症機序解明
- 2021 - 2024 Comprehensive elucidation of the pathophysiology of myopia by big data analysis
- 2021 - 2024 日本人集団ゲノムワイドクロマチン相互作用情報と構造多型との関連解析と疾患要因探索
- 2020 - 2023 Pathogenesis of age-related macular degeneration and pachychoroid neovasculopathy
- 2018 - 2021 Time-series muti-layered omics analysis during gestation period towards precision medicine
- 2018 - 2021 Construction of eQTL database during pregnant period
- 2018 - 2021 Preparation and Application of Y chromosome Panel using BirThree Cohort Men
- 2015 - 2019 Association of microbiome profile with skeletal muscle function
- 2012 - 2015 A computer simulation model for glycemic control for the improvement of medication regimen compliance in patients with diabetes mellitus
- 2010 - 2015 Development of Systems Cancer Research by Computation and Simulation
- 2011 - 2012 RNA-Seq data analysis for ncRNA function prediction to thousands public RNA-Seq data on super computer
- 2010 - 2012 Drug-response pathway analysis methods based on network analysis
- 2009 - 2011 Investigation of Kampo medicine mechanism against the infection via type 1 interferon producing cells
- 2009 - 2011 Relations between characteristic features of biological dynamic pathway models and gene polymorphisms or gene functions
- 2008 - 2009 Visual model checking approach of high level Petri-net and its application to dynamic biological pathway model
- 2005 - 2009 Estimation and simulation of gene networks for developing in silico biological networks
- 2006 - 2008 In Silico Search for Drug Target Pathways by Gene Networks
- 2006 - 2007 高機能ペトリネットによる動的生命パスウェイモデルの視覚的デバッグ手法の開発と適用
- 2005 - 2005 がん発生・抑止機構の計算機モデル化によるシステム的理解と新分子標的推定手法の開発
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Papers (243)：
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Nobuo Fuse, Masae Kimura, Ai Shimizu, Seizo Koshiba, Teruhiko Hamanaka, Makoto Nakamura, Nobuo Ishida, Hiroshi Sakai, Yoko Ikeda, Kazuhiko Mori, et al. Mutations of CYP1B1 and FOXC1 genes for childhood glaucoma in Japanese individuals. Japanese Journal of Ophthalmology. 2024
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Reiko Yoshida, Tomoko Kaneyasu, Arisa Ueki, Hideko Yamauchi, Shozo Ohsumi, Shinji Ohno, Daisuke Aoki, Shinichi Baba, Junko Kawano, Naomichi Matsumoto, et al. High-risk pathogenic germline variants in blood relatives of BRCA1/2 negative probands. Breast Cancer. 2024
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Takeo Naito, Ryuya Osaka, Yoichi Kakuta, Yosuke Kawai, Seik-Soon Khor, Junji Umeno, Katsushi Tokunaga, NCBN Controls WGS Consortium, Hantsue Ishibashi-Ueda, Tsutomu Tomita, et al. Genetically Predicted Higher Levels of Caffeic Acid Are Protective Against Ulcerative Colitis: A Comprehensive Metabolome Analysis. Inflammatory Bowel Diseases. 2024
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Kouyuki Hirayasu, Seik-Soon Khor, Yosuke Kawai, Mihoko Shimada, Yosuke Omae, Gen Hasegawa, Yuko Hashikawa, Hiromu Tanimoto, Jun Ohashi, Kazuyoshi Hosomichi, et al. Identification of the hybrid gene LILRB5-3 by long-read sequencing and implication of its novel signalling function. Frontiers in Immunology. in press. 2024
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Yuki Hitomi, Kazuko Ueno, Yoshihiro Aiba, Nao Nishida, Michihiro Kono, Mitsuki Sugihara, Yosuke Kawai, Minae Kawashima, Seik-Soon Khor, Kazuhiro Sugi, et al. A genome-wide association study identified PTPN2 as a population-specific susceptibility gene locus for primary biliary cholangitis. Hepatology (Baltimore, Md.). 2024
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MISC (80)：
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人見祐基, 相葉佳洋, 植野和子, 西田奈央, 河合洋介, 川嶋実苗, 築地信, 岩渕千里, 高田紗奈美, 三宅紀子, et al. 様々な免疫形質と関連するCD28領域におけるスプライシング制御バリアントの同定. 日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集. 2022. 67th (CD-ROM)
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人見祐基, 相葉佳洋, 植野和子, 西田奈央, 河合洋介, 川嶋実苗, 安波道朗, GERVAIS Olivier, 長崎正朗, 徳永勝士, et al. 原発性胆汁性胆管炎(PBC)感受性遺伝子CCR6/FGFR1OPにおけるprimary functional variantsの同定. 日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集. 2021. 66th (CD-ROM)
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山口泉, 川口喬久, 寺岡亮, 稲富雄一, 深沢圭一郎, 関谷勇司, 塙敏博, 大川恭行, 王妍雁, GREVAIS Oliver, et al. クラウドサーバとオンプレミスサーバを組み合わせたハイブリッドシステムの構築と活用. 日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集. 2021. 66th (CD-ROM)
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OLIVIER Gervais, 河合洋介, 長崎正朗, 長崎正朗. Common disease解析の最前線 9.ポリジェニックモデルによるゲノム情報解析の最前線. 遺伝子医学. 2021. 11. 2
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長崎正朗, 長崎正朗, 山口泉, 川口喬久, 寺岡亮, 稲富雄一, 深沢圭一郎, 関谷勇司, 塙敏博, 大川恭行, et al. Large-Scale Human Genome Analysis in Genomic Medicine and Utilization of Hybrid Cloud Computing System. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
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Books (8)：
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遺伝学の百科事典
丸善出版 2022
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遺伝子医学36号,特集:Common disease解析の最前線
メディカルドゥ 2021
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Human Molecular Genetics Fifth Edition
2021
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NGSアプリケーション 実験プロトコール
2016
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ジャポニカアレイの設計と全ゲノムインピュテーションによる活用
月刊メディカル・サイエンス・ダイジェスト 2015
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Lectures and oral presentations (52)：
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ハイブリッドクラウド構築とゲノム情報解析の効率的な運用に関した研究
(学際大規模情報基盤共同利用・共同研究拠点 第 14回シンポジウム 2022)
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日本人の公開可能な長鎖型集団パネル構築とその意義について
(PacBio ユーザーグループミーティング 2022 2022)
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Large-Scale Human Genome Analysis in Genomic Medicine and Utilization of Hybrid Cloud Computing System
(2021)
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ハイブリッドクラウド構築とゲノム情報解析の効率的な運用に関した研究
(2021)
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Accelerating the pace of research in Kyoto University
(AWS Public Sector Summit Online 2021 2021)
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Professional career (1)：
- Ph.D. (Science) (The University of Tokyo)
Awards (2)：
- 2017/08 - 情報処理学会DICOMO2017実行委員会 最優秀論文賞 プライバシ保護ゲノム解析のための秘密計算フィッシャー正確検定の実装評価
- 2011/10 - IEEE (The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc.) IEEE BioVis 2011 Contest Award
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