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J-GLOBAL ID:201801006895806923   Update date: Mar. 11, 2024

Tanizawa Yasuhiro

Tanizawa Yasuhiro
Affiliation and department:
Job title: Assistant Professor
Research field  (1): Genomics
Research theme for competitive and other funds  (1):
  • 2020 - 2023 ゼニゴケゲノムDBの拡張開発と仮想化技術を応用した高可搬性ゲノムDBの開発
Papers (64):
  • Chihiro Furumizu, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura. Genome Annotation Matters: From Genes to Phylogenetic Inferences. Plant & cell physiology. 2023
  • Takeshi Ara, Yuichi Kodama, Toshiaki Tokimatsu, Asami Fukuda, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2023: the MetaboBank for metabolomics data and associated metadata. Nucleic acids research. 2023
  • Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takuro Nakayama, Goro Tanifuji, Ryoma Kamikawa, Yasukazu Nakamura. A practical assembly guideline for genomes with various levels of heterozygosity. Briefings in Bioinformatics. 2023. 24. 6
  • Ken-ichi Kurotani, Hideki Hirakawa, Kenta Shirasawa, Koya Tagiri, Moe Mori, Yasunori Ichihashi, Takamasa Suzuki, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Sachiko Isobe, et al. Establishing a comprehensive web-based analysis platform forNicotiana benthamianagenome and transcriptome. 2023
  • Fumitaka Shitamori, Ayaka Nonogaki, Tomoki Motegi, Yuki Matsumoto, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Tomohiro Yonezawa, Yasuyuki Momoi, Shingo Maeda. Large-scale epidemiological study on feline autosomal dominant polycystic kidney disease and identification of novel PKD1 gene variants. Journal of feline medicine and surgery. 2023. 25. 7. 1098612X231185393
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MISC (55):
  • 黒谷賢一, 平川秀樹, 白澤健太, 谷澤靖洋, 中村保一, 磯部祥子, 野田口理孝, 野田口理孝. 生物間相互作用のモデル植物であるNicotiana benthamianaのゲノム解読. 日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM). 2023. 87th
  • 谷澤靖洋, 川村省吾, ROMANI Facundo, 矢倉勝, 望月孝子, 坂本美佳, 山岡尚平, 西浜竜一, 中村保一, 大和勝幸, et al. Marpolbase: development of the genome and expression database for the liverwort Marchantia polymorpha. 日本植物生理学会年会(Web). 2023. 64th
  • 衣川達己, 谷澤靖洋, 中村保一, 伊藤武彦, 田中裕之, 平川英樹, 篠澤章久, 篠澤章久, 馬場正, 小田賢司, et al. Comparative genomic analysis of 25 peach cultivars. 園芸学研究 別冊. 2023. 22. 1
  • 岩崎美雪, 梶原智明, 安居佑季子, 吉竹良洋, 宮崎基, 川村昇吾, 末次憲之, 末次憲之, 西浜竜一, 西浜竜一, et al. 苔類ゼニゴケの性染色体上の性決定因子の同定. 日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM). 2022. 86th
  • 川村昇吾, ROMANI Facundo, 矢倉勝, 望月孝子, 坂本美佳, 山岡尚平, 西浜竜一, 中村保一, 大和勝幸, BOWMAN John, et al. MarpolBase Expression(MBEX):苔類ゼニゴケにおけるトランスクリプトームの可視化・解析データベース. 日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM). 2022. 86th
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Books (4):
  • 月刊アグリバイオ 2023年3月号 特集:コケ植物:遺伝子資源と機能応用
    北隆館 2023
  • メタゲノムデータ解析 : 16Sも!ショットガンも!ロングリードも!菌叢解析が得意になる凄技レシピ
    羊土社 2021 ISBN:9784758122559
  • 実験医学別冊・独習 Pythonバイオ情報解析
    羊土社 2021
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本 改訂第2版
    学研メディカル秀潤社, 学研プラス(発売) 2019 ISBN:9784780909838
Lectures and oral presentations  (7):
  • Database resources of DDBJ for microbial genome assemblies and annotations
    (World Data Centre for Microorganism 2023 Annual Meeting 2023)
  • High quality reference genome sequences of liverwort Toward completion of the Marchantia Genome Project
    (Taiwan Japan Plant Biology 2023)
  • Microbial Genome Analysis
    (Thailand-Japan Bilateral Workshop on Bioinformatics and Bioresources 2022)
  • ゲノム解析から紐解く乳酸菌の多様性
    (日本乳酸菌学会設立30周年記念シンポジウム 2021)
  • DDBJにおけるSARS-Cov-2ゲノムのデータ登録・公開への取り組み
    (2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・ 第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021) 2021)
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Professional career (1):
  • PhD (The University of Tokyo)
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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