Nakamura Yoji

Research field (1)： Marine/Aquatic life sciences

Research keywords (3)：バイオインフォマティクス , 比較ゲノム , 分子進化

Research theme for competitive and other funds (12)：

2021 - 2024 マグロの雌雄を決定する遺伝子およびその作用機序の解明
2020 - 2024 In search of genes related to the life-history polymorphism in the Japanese eel Anguilla japonica: a population genomics approach
2019 - 2022 Role of NPR1 gene in regulating Susabi-nori (Porphyra yezoensis) immunity
2017 - 2020 Comparative Biology of Parmales and diatoms to explore the origin and sucess of diatoms
2014 - 2018 Biology of Pramles, a sister picoplanktonic group of diatoms

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Papers (77)：

Takao Hayashida, Satoshi Soma, Yoji Nakamura, Kentaro Higuchi, Yukinori Kazeto, Koichiro Gen. Transcriptome characterization of gonadal sex differentiation in Pacific bluefin tuna, Thunnus orientalis (Temminck et Schlegel). Scientific Reports. 2023. 13. 1
Hiroki Ban, Shinya Sato, Shinya Yoshikawa, Kazumasa Yamada, Yoji Nakamura, Mutsuo Ichinomiya, Naoki Sato, Romain Blanc-Mathieu, Hisashi Endo, Akira Kuwata, et al. Genome analysis of Parmales, the sister group of diatoms, reveals the evolutionary specialization of diatoms from phago-mixotrophs to photoautotrophs. Communications biology. 2023. 6. 1. 697-697
Kazutoshi Yoshitake, Atushi Fujiwara, Aiko Matsuura, Masashi Sekino, Motoshige Yasuike, Yoji Nakamura, Reiichiro Nakamichi, Masaaki Kodama, Yumiko Takahama, Akinori Takasuka, et al. Estimation of tuna population by the improved analytical pipeline of unique molecular identifier-assisted HaCeD-Seq (haplotype count from eDNA). SCIENTIFIC REPORTS. 2021. 11. 1
Yoji Nakamura, Kentaro Higuchi, Kazunori Kumon, Motoshige Yasuike, Toshinori Takashi, Koichiro Gen, Atushi Fujiwara. Prediction of the Sex-Associated Genomic Region in Tunas (Thunnus Fishes). International journal of genomics. 2021. 2021. 7226353-7226353
Kentaro Higuchi, Yukinori Kazeto, Yuichi Ozaki, Toshiya Yamaguchi, Yukinori Shimada, Yoshiaki Ina, Satoshi Soma, Yoshitaka Sakakura, Rie Goto, Takahiro Matsubara, et al. Author Correction: Targeted mutagenesis of the ryanodine receptor by Platinum TALENs causes slow swimming behaviour in Pacific bluefin tuna (Thunnus orientalis) (Scientific Reports, (2019), 9, 1, (13871), 10.1038/s41598-019-50418-3). Scientific Reports. 2020. 10. 1. 9351-9351

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MISC (71)：

宇治督, 佐野菜摘, 山口智史, 三好花歩, 風藤行紀, 奥澤公一, 安池元重, 中村洋路, 關野正志, 細谷将. Genetic structure analysis of Coral trout, Plectropomus leopardus, using Gras-Di genotyping technology. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
宇治督, 山口智史, 安池元重, 中村洋路, 關野正志, 細谷将. GRAS-Di法におけるスジアラPlectropomus leopardusに適したプライマーセットの検討. 日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM). 2021. 2021
坂井貴光, 中村洋路, 山崎雅俊, 米加田徹, 佐藤純, 藤原篤志, 安池元重, 森広一郎. Microsporidium seriolaeのゲノム解析. 日本魚病学会大会プログラムおよび講演要旨. 2019. 2019. 30
中村洋路, 張成年, 斉藤憲治, 斉藤憲治, 藤原篤志, 安池元重, 馬久地みゆき, 尾島信彦. ニホンウナギの視覚遺伝子の起源をゲノムから探る. 研究のうごき(Web). 2018. 16. 12 (WEB ONLY)
松山知正, 高野倫一, 安池元重, 中村洋路, 藤原篤志, 小田原和史, 正岡哲治. アコヤガイ赤変病の病原体と推定されたスピロヘータの定量PCRによる疫学的解析. 日本水産学会大会講演要旨集. 2018. 2018. 60

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Books (1)：

Marine Metagenomics: Technological Aspects and Applications
Springer 2019 ISBN:9789811381331

Lectures and oral presentations (9)：

NGSと水産研究
(第201回農林交流センターワークショップ「次世代シーケンサーの解析技術」 2016)
ゲノム情報からみたエドワジエラ症原因菌の多様性
(第17回マリンバイオテクノロジー学会大会 2015)
ノリゲノム解読~紅藻のモデル生物として~
(平成26年度日本水産学会春季大会 2014)
水産生物のゲノム解読
(NGSワークショップ 2014)
海産紅藻スサビノリのゲノム解読
(マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集 2013)

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Professional career (1)：

Ph.D (The Graduate University for Advanced Studies)

Work history (9)：

2020/07 - 現在国立研究開発法人水産研究・教育機構水産資源研究所水産資源研究センター生命情報解析部主任研究員
2019/04 - 現在 Kitasato University School of Marine Biosciences
2016/04 - 2020/07 国立研究開発法人水産研究・教育機構中央水産研究所水産生命情報研究センター主任研究員
2014/04 - 2016/03 独立行政法人水産総合研究センター中央水産研究所水産遺伝子解析センター主任研究員
2013/08 - 2014/03 独立行政法人水産総合研究センター中央水産研究所水産遺伝子解析センター研究員

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※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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