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J-GLOBAL ID：201901012453171390
Update date: Feb. 01, 2024
Murakami Takumi
ムラカミ タクミ | Murakami Takumi
Affiliation and department：
Research field (2)：
Genomics
, Ecology and environmental science
Research keywords (4)：
氷河生態系
, メタゲノム
, 共生
, 雪氷生物
Research theme for competitive and other funds (3)：
- 2023 - 2026 古代DNA解析技術を用いた絶滅哺乳類史の刷新
- 2022 - 2026 国内に現存する氷河を拠点に据えた氷河生態系の時空間的多様性解析
- 2019 - 2021 メタゲノムデータから解き明かす氷河シアノバクテリアの世界的な多様性
Papers (22)：
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Hiroshi Mori, Tamotsu Kato, Hiroaki Ozawa, Mitsuo Sakamoto, Takumi Murakami, Todd D Taylor, Atsushi Toyoda, Moriya Ohkuma, Ken Kurokawa, Hiroshi Ohno. Assessment of metagenomic workflows using a newly constructed human gut microbiome mock community. DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes. 2023. 30. 3
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Taro Onuma, Toshitaka Yamauchi, Hina Kosakamoto, Hibiki Kadoguchi, Takayuki Kuraishi, Takumi Murakami, Hiroshi Mori, Masayuki Miura, Fumiaki Obata. Recognition of commensal bacterial peptidoglycans defines Drosophila gut homeostasis and lifespan. PLoS genetics. 2023. 19. 4. e1010709
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Kana Morinaga, Hiroyuki Kusada, Sachiko Sakamoto, Takumi Murakami, Atsushi Toyoda, Hiroshi Mori, Xian-Ying Meng, Motoko Takashino, Kazutoshi Murotomi, Hideyuki Tamaki. Granulimonas faecalis gen. nov., sp. nov., and Leptogranulimonas caecicola gen. nov., sp. nov., novel lactate-producing Atopobiaceae bacteria isolated from mouse intestines, and an emended description of the family Atopobiaceae. International journal of systematic and evolutionary microbiology. 2022. 72. 10
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Kyosuke Yakabe, Seiichiro Higashi, Masahiro Akiyama, Hiroshi Mori, Takumi Murakami, Atsushi Toyoda, Yuta Sugiyama, Shigenobu Kishino, Kenji Okano, Akiyoshi Hirayama, et al. Dietary-protein sources modulate host susceptibility to Clostridioides difficile infection through the gut microbiota. Cell reports. 2022. 40. 11. 111332-111332
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Takumi Murakami, Nozomu Takeuchi, Hiroshi Mori, Yuu Hirose, Arwyn Edwards, Tristram Irvine-Fynn, Zhongqin Li, Satoshi Ishii, Takahiro Segawa. Metagenomics reveals global-scale contrasts in nitrogen cycling and cyanobacterial light-harvesting mechanisms in glacier cryoconite. Microbiome. 2022. 10. 1. 50-50
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MISC (4)：
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村上匠. スポットライト:イケメン&イケジョ VOL. 42 村上匠. 日本微生物生態学会誌. 2019. 34. 2. 64-65
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村上 匠, 瀬川 高弘, Dylan Bodington, 竹内 望, 幸島 司郎, 本郷 裕一. P24-3 氷河環境に特化したコオリミミズの共生細菌群集構造解析(ポスター発表). 日本微生物生態学会講演要旨集. 2014. 2014. 235-235
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村上 匠, 瀬川 高弘, Bodington Dylan, Labarca Pedro, Sepulveda Gonzalo Barcaza, 竹内 望, 幸島 司郎, 本郷 裕一. PD-009 氷河特異的無脊椎動物における共生細菌群集構造解析(極限環境微生物,ポスター発表). 日本微生物生態学会講演要旨集. 2013. 29. 116-116
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Murakami Takumi, Segawa Takahiro, Yamada Akinori, Bodington Dylan, Takeuchi Nozomu, Kohshima Shiro, Hongoh Yuichi. PD-08 Census of bacteria associated with glacier ice worms in Alaska(PD Extremophiles,Poster session). 2012. 28. 150-150
Books (1)：
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実験医学増刊 腸内細菌叢 健康と疾患を制御するエコシステム
羊土社 2019
Lectures and oral presentations (3)：
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氷河細菌群集の地球規模での多様性をメタゲノム解析で解き明かす
(静岡大学 グリーン科学技術研究所 共同利用機器セミナー 2023)
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メタゲノムデータから紐解く氷河シアノバクテリアの多様性
(藍藻の分子生物学2022 2022)
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無脊椎動物と細菌の共生に着目した新たな雪氷生態系の研究
(日本微生物生態学会 第33回大会 2019)
Education (3)：
- 2013 - 2017 Tokyo Institute of Technology Graduate School of Bioscience and Biotechnology
- 2011 - 2013 Tokyo Institute of Technology Graduate School of Bioscience and Biotechnology
- 2008 - 2011 Tokyo Institute of Technology School of Bioscience and Biotechnology
Professional career (1)：
Work history (3)：
- 2023/08 - 現在 Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology Assistant Professor
- 2018/04 - 2023/07 National Institute of Genetics
- 2017/04 - 2018/03 Tokyo Institute of Technology School of Life Science and Technology
Committee career (1)：
- 2022 - 現在 日本微生物生態学会 和文誌編集委員
Awards (3)：
- 2023/03 - 日本ゲノム微生物学会 若手賞
- 2017 - The 7th International Conference on Polar & Alpine Microbiology 2nd Poster Prize
- 2014 - 環境微生物学系合同大会2014 ポスター賞
Association Membership(s) (3)：
日本雪氷学会
, 日本ゲノム微生物学会
, 日本微生物生態学会
