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J-GLOBAL ID：201901012458136550
Update date: Sep. 17, 2024
Honda Mizuki
Honda Mizuki
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Affiliation and department：
Kyoto University
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Research field (4)：
Neuroscience - general
, Developmental biology
, Systems genomics
, Molecular biology
Research keywords (8)：
トランスクリプトミクス
, 神経幹細胞
, RNA-seq
, ゲノミクス解析
, シグナル伝達
, 発生・分化
, エピジェネティクス
, 神経発生
Research theme for competitive and other funds (10)：
2024 - 2027 グリア細胞制御による認知症の予防と治療への革新的アプローチ
2024 - 2026 神経回路イメージングに基づくクロマチンセンサス
2023 - 2026 フィロスタシスを「予測」し、「操る」技術の開発
2023 - 2024 化学的手法を用いて空間的な発現制御を解明する
2022 - 2024 Aged-related neurogenesis during and onset mechanism of dementia
2020 - 2023 化学的手法を用いて空間的な発現制御を解明する
2021 - 2022 空間的なエピゲノム情報取得法の開発
2019 - 2021 関心領域に限定可能なRNA-seq法の開発
2019 - 2020 関心領域に限定可能な遺伝子発現情報取得法の開発
2014 - 2015 マウス胎生期脳に存在する神経幹細胞の増殖・分化制御に関するアルギニンメチル化酵素の同定とその機能解析
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Papers (5)：
Biallelic null variants in PNPLA8 cause microcephaly by reducing the number of basal radial glia. 2024
Mizuki Honda, Ryuichi Kimura, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Kaori Tanaka, Yasuyuki Ohkawa, Shinya Oki. Photo-isolation chemistry for high-resolution and deep spatial transcriptome with mouse tissue sections. STAR Protocols. 2022. 3. 2. 101346-101346
Sayako Katada, Jun Takouda, Takumi Nakagawa, Mizuki Honda, Katsuhide Igarashi, Takuya Imamura, Yasuyuki Ohkawa, Shoko Sato, Hitoshi Kurumizaka, Kinichi Nakashima. Neural stem/precursor cells dynamically change their epigenetic landscape to differentially respond to BMP signaling for fate switching during brain development. Genes & Development. 2021. 35. 21-22. 1431-1444
Mizuki Honda, Shinya Oki, Ryuichi Kimura, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Kaori Tanaka, Chikara Meno, Yasuyuki Ohkawa. High-depth spatial transcriptome analysis by photo-isolation chemistry. Nature Communications. 2021. 12. 1
Mizuki Honda, Kinichi Nakashima, Sayako Katada. PRMT1 regulates astrocytic differentiation of embryonic neural stem/precursor cells. JOURNAL OF NEUROCHEMISTRY. 2017. 142. 6. 901-907
Books (6)：
空間トランスクリプトーム技術
月刊細胞 2023
空間トランスクリプトミクス
生物工学会誌 第100巻 2022
Photo-Isolation Chemistry:光照射による高解像度かつ高感度なトランスクリプトーム技術
実験医学 39(14) 2021
局所的かつ高深度の空間トランスクリプトーム技術 - Photo-Isolation Chemistry
実験医学別冊「クロマチン解析プロトコール」 2020
Human Neural Stem Cells (From Generation to Differentiation and Application)
Springer 2018
ｍore...
Lectures and oral presentations (30)：
High-depth Spatial Regulomics Considering Microstructure
(The 95th Meeting of The Zoological Society of Japan in Nagasaki 2024)
Photo-Isolation Chemistry による組織内遺伝子発現の高深度空間解析
(岡山大学大学院 環境生命自然科学研究科 第472 回 生物科学セミナー 2024)
ミクロ組織を踏まえた高解像度かつ高深度空間トランスクリプトーム技術
(第51回日本毒性学会学術年会 2024)
ミクロ組織を踏まえた高解像度かつ高深度空間トランスクリプトーム技術
(第67回 日本腎臓学会学術総会 2024)
光学と化学を融合した 新規空間オミクス技術の開発
(日本ケミカルバイオロジー学会 第18回年会 2024)
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Education (4)：
2014 - 2018 九州大学大学院 医学系学府 医学専攻
2013 - 2014 九州大学大学院 医学系学府 医科学専攻
2012 - 2013 Nara Institute of Science and Technology Graduate School of Biological Sciences
2008 - 2012 Kindai University Faculty of Biology-Oriented Science and Technology Department of Genetic Engineering
Professional career (1)：
博士(医学) (九州大学)
Work history (5)：
2024/04 - 現在 Hiroshima University Graduate School of Integrated Sciences for Life Tenure Track Assistant Professor
2020/10 - 2024/03 国立研究開発法人科学技術振興機構(JST)ACT-X 研究員(兼任)
2020/04 - 2024/03 京都大学大学院 医学研究科 メディカルイノベーションセンター 特定助教
2018/10 - 2020/03 九州大学大学院 医学研究院 発生再生医学分野 助教
2018/04 - 2018/09 九州大学大学院 医学研究院 発生再生医学分野 学術研究員
Awards (1)：
2019/11 - 新学術領域 「個性」創発脳、第4回 若手の会・技術支援講習会 ベストポスター賞 光照射した領域に限定可能なRNA-seq法の開発
Association Membership(s) (4)：
The Society for Biotechnology, Japan
, Japan Bioindustry Association
, 日本発生生物学会
, THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in
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