Pat

J-GLOBAL ID：201903007189033343

トランスクリプトーム解析装置及び解析方法

Inventor： 近藤 聡 ,  大音 徳 ,  阿部 円佳 ,  青木 直大 ,  福田 あかり ,  廣瀬 竜郎 ,  永野 惇
Applicant, Patent owner： 国立大学法人 東京大学 ,  トヨタ自動車株式会社 ,  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 ,  学校法人 龍谷大学
Agent (1)： 特許業務法人平木国際特許事務所
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2018003697
Publication number (International publication number)：2019125045
Application date： Jan. 12, 2018
Publication date： Jul. 25, 2019
Summary：

【課題】転写産物に関する塩基配列データを用いて、より高精度なトランスクリプトーム解析を行う。【解決手段】目的変数データと遺伝子発現量データとを含む複数のデータセットに対して、遺伝子発現量データをランダムに削減した複数のサブデータセットを生成し、複数のサブデータセットに対して正則化法を適用してそれぞれ予測式を算出し、予測式に含まれる遺伝子のリストを生成する。【選択図】図2

Claim (excerpt)：

目的変数データと遺伝子発現量データとを含む複数のデータセットに対して、遺伝子発現量データをランダムに削減した第1〜第mのサブデータセット(m≧2)を生成するデータセット生成手段と、 第1〜第mのサブデータセットのそれぞれに対して正則化項を有する回帰分析法を適用して、目的変数データを目的変数とし遺伝子発現量データを説明変数とする第1〜第mの予測式を算出する予測式算出手段と、 第1〜第mの予測式に含まれる遺伝子発現量データに対応する遺伝子のリストを生成する遺伝子リスト生成手段と を備えるトランスクリプトーム解析装置。

IPC (4)：

G16B 40/00 ,  C12M 1/00 ,  C12Q 1/68 ,  G16B 25/00

FI (4)：

G06F19/24 ,  C12M1/00 A ,  C12Q1/68 A ,  G06F19/20

F-Term (21)：

4B029AA07 ,  4B029BB01 ,  4B029BB12 ,  4B029DG10 ,  4B029FA09 ,  4B029FA15 ,  4B063QA01 ,  4B063QA20 ,  4B063QQ04 ,  4B063QQ09 ,  4B063QQ42 ,  4B063QQ52 ,  4B063QR32 ,  4B063QR35 ,  4B063QR73 ,  4B063QR78 ,  4B063QS28 ,  4B063QS36 ,  4B063QS39 ,  4B063QX02 ,  4B063QX10

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (3)

• データ解析方法及びそのシステム
  Gazette classification：公開公報   Application number：特願2003-150168   Applicant：石原産業株式会社
• データ解析装置および方法
  Gazette classification：再公表公報   Application number：JP2003004059   Applicant：石原産業株式会社
• 情報処理装置及びプログラム
  Gazette classification：公開公報   Application number：特願2014-170859   Applicant：ケーディーアイコンズ株式会社