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J-GLOBAL ID:201903011613349884

エピトープ予測方法及びエピトープ予測システム

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (3): 平川 明 ,  関根 武彦 ,  今堀 克彦
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2018067724
Publication number (International publication number):2019179356
Application date: Mar. 30, 2018
Publication date: Oct. 17, 2019
Summary:
【課題】タンパク質内のエピトープ候補の取得を容易にする。【解決手段】端末からの要求に応じて、予測対象タンパク質に含まれるエピトープの候補を、学習対象タンパク質と当該学習対象タンパク質から検出されているエピトープとの関係を学習用データとして用いた学習済みモデルの出力結果に基づいて取得し、エピトープの候補を出力する、エピトープ予測方法である。学習用データは、学習対象タンパク質に含まれる複数のアミノ酸について、アミノ酸の所定の特性が数値化されたスコアに基づく入力値と、当該学習対象タンパク質から検出されているエピトープに含まれているか否かを示す情報であるラベルと、を含む。学習済みモデルは、予測対象タンパク質に含まれる複数のアミノ酸について、スコアに基づく入力値に対して、エピトープに含まれるか否かを示す情報を出力する。【選択図】図8
Claim (excerpt):
端末からの要求に応じて、予測対象タンパク質に含まれるエピトープの候補を、学習対象タンパク質と前記学習対象タンパク質から検出されているエピトープとの関係を学習用データとして用いた学習済みモデルの出力結果に基づいて取得し、 前記取得されたエピトープの候補を出力する、 エピトープ予測方法。
IPC (1):
G16B 40/00
FI (1):
G06F19/24

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