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J-GLOBAL ID：202001002669109910
Update date: Dec. 08, 2025
Tanimoto Shoichi
タニモト ショウイチ | Tanimoto Shoichi
Affiliation and department：
Job title：
Assistant professor
Homepage URL (1)：
https://sites.google.com/view/stanimoto/Home
Research field (2)：
Biophysics
, Bio-, chemical, and soft-matter physics
Research keywords (10)：
protein aggregation
, アミロイド
, ポリグルタミン
, ハンチントン病
, 凝集阻害
, molecular dynamics simulation
, 拡張アンサンブル法
, integral equation theory
, RISM/3D-RISM
, molecular recognition
Research theme for competitive and other funds (8)：
- 2025 - 2026 ハンチントン病原因タンパク質の凝集機構とアルギニン誘導体による凝集阻害機構の理論的解析
- 2025 - 2026 タンパク質界面での重水・非水溶媒との水素結合動態の解明
- 2025 - 2026 ポリグルタミンタンパク質の凝集に対するアルギニンの阻害機構の理論的解明
- 2023 - 2025 ハンチントン病原因蛋白質の凝集機構とアルギニン誘導体による凝集阻害機構の理論研究
- 2024 - 2025 ハンチントン病原因タンパク質の凝集機構とアルギニン誘導体による凝集阻害機構の理論的解析
- 2022 - 2025 ハンチントン病原因蛋白質の凝集機構とアルギニン誘導体による凝集阻害機構の理論研究
- 2021 - 2025 Theoretical study of the aggregation inhibition process of polyglutamine peptide by arginine
- 2019 - 2020 溶媒が誘起するタンパク質の遅く大きな構造変化を記述する新規理論手法の開発
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Papers (13)：
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Yuki Seno, Kodai Kanemaru, Shoichi Tanimoto, Tatsuhiko Miyata, Haruyuki Nakano, Norio Yoshida. Applicability of integral equation theory of molecular liquids to the hydration thermodynamic response to charged particles. Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 2025. 674. 130787
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Shoichi Tanimoto, Hisashi Okumura. Why Is Arginine the Only Amino Acid That Inhibits Polyglutamine Monomers from Taking on Toxic Conformations?. ACS Chemical Neuroscience. 2024. 15. 15. 2925-2935
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Shoichi TANIMOTO, Hisashi OKUMURA. Theoretical Analysis of the Aggregation-Inhibition Effect of Arginine on Polyglutamine Protein by the Generalized-Ensemble Method. Journal of Computer Chemistry, Japan. 2023. 22. 2. 18-20
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谷本 勝一. 液体の積分方程式理論による溶媒が生体分子の機能と構造に及ぼす影響の理論的研究. 溶液化学研究会誌. 2022. 2. 14-18
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Shoichi Tanimoto, Satoru G. Itoh, Hisashi Okumura. State-of-the-Art Molecular Dynamics Simulation Studies of RNA-Dependent RNA Polymerase of SARS-CoV-2. International Journal of Molecular Sciences. 2022. 23. 18. 10358
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MISC (3)：
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Shoichi Tanimoto, Satoru G. Itoh, Hisashi Okumura. Molecular Simulations of RNA-Dependent RNA Polymerase of SARS-CoV-2. Encyclopedia. 2023
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谷本 勝一, 吉田 紀生, 中野 晴之. 業績紹介: Ca2+依存性糖質結合モジュールの糖認識における溶媒和の影響を解明. 新学術領域研究「柔らかな分子系」ニュースレター. 2016. 平成28年08月号. No. 36. 263
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谷本 勝一. IUPAC2015参加およびSihyun Ham研究室訪問報告. 新学術領域研究「柔らかな分子系」ニュースレター. 2015. 平成27年09月号. No. 25. 185
Lectures and oral presentations (49)：
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重水中のタンパク質の動態: ホフマイスター系列塩効果
(九州コロイドコロキウム2025 2025)
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カフェインによるタウタンパク質凝集抑制機構の分子動力学的解析
(第12回日本アミロイドーシス学会学術集会 2025)
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カフェインによるタウタンパク質凝集阻害メカニズムの分子動力学シミュレーション
(タウ研究会2025 2025)
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アルギニンによるポリグルタミンタンパク質モノマーの毒性構造形成阻害の理論研究
(第50回生体分子科学討論会 2024)
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ポリグルタミンタンパク質の凝集阻害機構のレプリカ置換分子動力学シミュレーション
(第37回分子シミュレーション討論会 2023)
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Education (3)：
- 2017 - 2020 Kyushu University Graduate School of Sciences Department of Chemistry
- 2015 - 2017 Kyushu University Graduate School of Sciences Department of Chemistry
- 2011 - 2015 Kyushu University School of Sciences Department of Chemistry
Professional career (1)：
- Ph.D. (Kyushu University)
Work history (3)：
- 2023/12 - 現在 National Institute of Technology, Kurume College Department of Biochemistry and Applied Chemistry Assistant professor
- 2022/04 - 2023/12 Exploratory Research Center on Life and Living Systems Department of Creative Research, Biomolecular Dynamics Simulation Group
- 2020/04 - 2022/03 Institute for Molecular Science
Committee career (6)：
Awards (2)：
- 2023/11 - JSST2023 Best Author Award
- 2019/10 - 溶液化学研究会 第42回溶液化学シンポジウムポスター賞
Association Membership(s) (8)：
日本シミュレーション学会
, 日本コンピュータ化学会
, 理論化学会
, 溶液化学研究会
, 分子シミュレーション学会
, 日本蛋白質科学会
, 分子科学会
, 日本生物物理学会
