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J-GLOBAL ID：202002229351479589   Reference number：20A2526068

Rapid bacterial identification method using nanopore DNA sequencer

感染症医療の未来を拓く新たな検査 ナノポアDNAシークエンサーを用いた迅速な細菌同定法

Author (5)： ONO AYUMU (東海大 医 基礎医学系 分子生命科学 情報生物医学研究室) ,  NAKAGAWA SO (東海大 医 基礎医学系 分子生命科学 情報生物医学研究室) ,  KRYUKOV Kirill (東海大 医 基礎医学系 分子生命科学 情報生物医学研究室) ,  KRYUKOV Kirill (遺伝研) ,  IMANISHI TADASHI (東海大 医 基礎医学系 分子生命科学 情報生物医学研究室)
Material： 臨床化学  (Japanese Journal of Clinical Chemistry)
Volume： 49  Issue： 4  Page： 265-270  Publication year： Oct. 30, 2020 
JST Material Number： Z0312B  ISSN： 0370-5633  CODEN： RIKAAN  Document type： Article
Article type： 解説  Country of issue： Japan (JPN)  Language： JAPANESE (JA)

Thesaurus term： automatic analyser ,...
Semi thesaurus term： ナノポアDNAシークエンサー ,...

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JST classification (4)： Infectious diseases,parasitics diseases in general.  (GD01010H) ,  Research methods in genetics  (EC01020N) ,  Microorganism test methods  (EG02020G) ,  Microorganism tests  (GC02030H)

Reference (13)：

• 中川 草, 三橋里美, Kryukov Kirill, 今西 規: 迅速な細菌種の組成解析, 実験医学, 36:32-37, 2018.
• Mitsuhashi S, Kryukov K, Nakagawa S, Takeuchi JS, Shiraishi Y, Asano K, et al.: A portable system for rapid bacterial composition analysis using a nanopore-based sequencer and laptop computer, Sci Rep, 7: 5657. 2017.
• Nakagawa S, Inoue S, Kryukov K, Yamagishi J, Ohno A, Hayashida K, et al.: Rapid sequencing-based diagnosis of infectious bacterial species from meningitis patients in Zambia, Clin Transl Immunology, 8: e01087, 2019.
• Kai S, Matsuo Y, Nakagawa S, Kryukov K, Matsukawa S, Tanaka H, et al.: Rapid bacterial identification by direct PCR amplification of 16S rRNA genes using the MinION TM nanopore sequencer. FEBS Open Bio, 9: 548-557, 2019.
• Li H: Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences, Bioinformatics, 34: 3094-3100, 2018.

Terms in the title (9)： 感染症 ,  医療 ,  未来 ,  検査 ,  ナノポア ,  DNA ,  シークエンサー ,  細菌 ,  同定法