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J-GLOBAL ID：202003004465982186

肺炎桿菌及び近縁菌種の遺伝子型タイピング法及びこれに用いるプライマーセット

Inventor： 荒川 宜親 ,  飯島 杏奈 ,  鈴木 匡弘 ,  川村 久美子
Applicant, Patent owner： 国立大学法人東海国立大学機構 ,  学校法人藤田学園
Agent (1)： 萩野 幹治
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2019010544
Publication number (International publication number)：2020115793
Application date： Jan. 24, 2019
Publication date： Aug. 06, 2020
Summary：

【課題】実際の産業(医療現場)利用に適した肺炎桿菌及び近縁菌種の菌株識別法を提供すること、並びにそれに用いるプライマーセットを提供すること。【解決手段】肺炎桿菌及び近縁菌種の染色体遺伝子配列上の、(1)genomic isletを構成するORF及び(2)genomic island中に存在するhyper variableなORFを構成するORFの有無を任意の順で検出し、これらORFの有無の組み合わせによる肺炎桿菌及び近縁菌種の菌株識別のための方法。【選択図】なし

Claim (excerpt)：

肺炎桿菌及び近縁菌種の染色体遺伝子配列上の、 (1)genomic isletを構成するORF、及び (2)genomic island中に存在するhyper variableなORFを構成するORF、 の有無を任意の順で検出し、これらORFの有無の組み合わせにより遺伝子型別分類を行うステップを含む、肺炎桿菌及び近縁菌種の菌株識別のための方法。

IPC (3)：

C12Q 1/686 ,  G01N 33/569 ,  C12Q 1/689

FI (3)：

C12Q1/686 Z ,  G01N33/569 F ,  C12Q1/689 Z

F-Term (21)：

4B063QA01 ,  4B063QA13 ,  4B063QA18 ,  4B063QA19 ,  4B063QQ02 ,  4B063QQ06 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR08 ,  4B063QR32 ,  4B063QR62 ,  4B063QS10 ,  4B063QS14 ,  4B063QS25 ,  4B063QX01 ,  4B065AA29X ,  4B065AA29Y ,  4B065AC20 ,  4B065BC03 ,  4B065BD16 ,  4B065CA23 ,  4B065CA46