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J-GLOBAL ID:202010009235749503   Research Resource code:NBDC02488

統合がんゲノムデータポータル

統合がんゲノムデータポータル
Owning Organization:
Resource classification: Database
Tag (subject)  (3): 健康/疾患 ,  ゲノム/遺伝子 ,  RNA
Tag (data type)  (3): 配列 ,  書誌/ドキュメント ,  発現
Species (1): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
Overview:
がんゲノム研究で集積されたゲノム、トランスクリプトーム、miRNAなどの研究プロジェクトに関する情報を整理したデータベースです。研究プロジェクトの概要、検体の解析方法、患者から提供された検体の属性(正常、腫瘍、性別、年代など)、臨床情報などを収録しています。ゲノムデータは、NBDCヒトデータベース (https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01348 ) に登録されており、アクセション番号と検体の属性情報とを掲載しています。また、トランスクリプトームおよびmiRNAデータは、NCBIのGEO (Gene Expression Omnibus)にも登録されています。がん種やデータの種類(WGS、WES 、mRNAトランスクリプトーム、miRNAトランスクリプトーム、アレイ 、RNA-seq 、RT-PCR)による絞り込みが可能です。 統合がんゲノムデータベース (https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00760 )の改訂版です。
Source: NBDC
Record maintainer: Integbio Database Catalog
Record license: Creative Commons CC0 license

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