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J-GLOBAL ID：202101001093711122
Update date: Nov. 28, 2024
Himeoka Yusuke
Himeoka Yusuke
Affiliation and department：
Homepage URL (1)：
http://www.yhimeoka.com
Research field (1)：
Biophysics
Research keywords (3)：
代謝
, 生物物理学
, システム生物学
Research theme for competitive and other funds (5)：
- 2022 - 2027 人工的代謝ネットワークを用いた静止相における細胞代謝ダイナミクスの研究
- 2024 - 2026 数理モデルを用いた分子システム適応度地形のデザイン原理の解明
- 2022 - 2024 化学反応動力学理論を用いた頑健な反応経路設計アルゴリズムの開発
- 2021 - 2023 細菌の休眠ダイナミクスを示す代謝ネットワーク構造の解明
- 2016 - 2018 細胞成長の効率に関する理論的研究
Papers (13)：
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Yusuke Himeoka, Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi. Theoretical basis for cell deaths. Physical Review Research. 2024
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Yusuke Himeoka, Chikara Furusawa. Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics in nonlinear regime: Hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity. 2024
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Yoshiyuki T Nakamura, Yusuke Himeoka, Nen Saito, Chikara Furusawa. Evolution of hierarchy and irreversibility in theoretical cell differentiation model. PNAS Nexus. 2023
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Yusuke Himeoka, Namiko Mitarai. Emergence of growth and dormancy from a kinetic model of the Escherichia coli central carbon metabolism. Physical Review Research. 2022
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Yusuke Himeoka, Julius B. Kirkegaard, Namiko Mitarai, Sandeep Krishna. Structural determinants of relaxation dynamics in chemical reaction networks. 2022
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MISC (3)：
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姫岡優介. 増殖している細胞のマクロ現象論とその破れ. 第68回物性若手夏の学校テキスト. 2024
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姫岡優介. 代謝モデルの「不都合な真実」と「細胞を創る」こと. 生物工学会誌. 2024. 102. 6. 285-285
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姫岡優介. 大腸菌の代謝動力学モデルにおける成長状態と休眠状態の出現. 生物物理. 2024. 64. 3
Books (1)：
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システム生物学入門
講談社 2023 ISBN:9784065334348
Work history (3)：
- 2021/01 - 現在 The University of Tokyo
- 2018/04 - 2020/12 Copenhagen University, Niels Bohr Institute Biocomplexity
- 2016/04 - 2018/03 日本学術振興会 特別研究員(DC2)
Awards (3)：
- 2024/06 - Nakatani Foundation Nakatani Foundation Award
- 2018/03 - 東京大学 一高賞
- 2015/03 - 東京大学 広域科学専攻奨励賞
Association Membership(s) (3)：
日本生物物理学会
, 日本分子生物学会
, 日本物理学会
