Rchr
J-GLOBAL ID:202101001861606996
Update date: Apr. 04, 2024
Okada Daigo
オカダ ダイゴ | Okada Daigo
Affiliation and department:
Research field (4):
Statistical science
, Genomics
, Biological, health, and medical informatics
, Systems genomics
Research keywords (4):
バイオインフォマティクス
, aging
, Statistical Genetics
, Computational Biology
Research theme for competitive and other funds (4):
- 2021 - 2023 幾何学と関数データ解析による医学・生命科学の時空間データマイニング
- 2021 - 2021 2021年度第I期若手研究者スタートアップ研究費
- 2019 - 2021 情報幾何を用いた、細胞集団プロファイルの異同とその生物学的背景の統合解析
- 2020 - 2021 1細胞発現データセットを対象とした機械学習
Papers (17):
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Jian Hao Cheng, Daigo Okada. Data-driven detection of age-related arbitrary monotonic changes in single-cell gene expression distributions. PeerJ. 2024. 12. e16851
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Jian Hao Cheng, Cheng Zheng, Ryo Yamada, Daigo Okada. Visualization of the landscape of the read alignment shape of ATAC-seq data using Hellinger distance metric. Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms. 2023
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Cheng Zheng, Man Wang, Ryo Yamada, Daigo Okada. Delving into gene-set multiplex networks facilitated by a k-nearest neighbor-based measure of similarity. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2023
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Daigo Okada. Application of a mathematical model to clarify the statistical characteristics of a pan-tissue DNA methylation clock. GeroScience. 2023
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Daigo Okada. Plasma proteins as potential biomarkers of aging of single tissue and cell type. Biogerontology. 2023
more...
MISC (4):
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Daigo Okada. Relationships between total, relative and absolute molecular abundance in aging genomics studies: Simple theoretical consideration. 2024
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岡田大瑚. 「注目論文:Our Focus on Genetics」大規模サイトメトリーデータを用いた、ヒトリンパ球プロファイルの個人差を対象とするゲノムワイド関連解析. 2021
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岡田大瑚, 中村直俊, 瀬藤和也, 川口喬久, 奈良原舞子, 日笠幸一郎, 田原康玄, 松田文彦, 山田亮. 多次元尺度法を用いたフローサイトメトリーデータからの特徴統計量の抽出およびトランスクリプトームデータとの対応関係の評価. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2016. 39th
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中村直俊, 岡田大瑚, 瀬藤和也, 川口喬久, 奈良原舞子, 日笠幸一郎, 田原康玄, 松田文彦, 山田亮. 多次元フローサイトメトリーデータの分布異同定量に基づくヒト免疫応答の個人差の解析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2016. 39th
Books (1):
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ポストGWAS時代の遺伝統計学 : オミクス解析と機械学習でヒト疾患を俯瞰する
羊土社 2023 ISBN:9784758104104
Lectures and oral presentations (25):
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Delve into inter-gene-set relationships using single-cell transcriptomic data
(2022)
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ATAC shape information provided biological insight
(2022)
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A mathematical model for the relationship between single cell expression profile and the bulk gene expression analysis
(2022)
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Information geometric approach to embed multiple single cell expression profiles into low dimensional coordinate space
(Pacifichem 2021 2021)
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Search and classification of DNA methylation biomarkers of aging focusing on nonlinear age-related changes
(2021)
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Education (4):
- 2018 - 2021 京都大学大学院 医学研究科 医科学専攻 博士課程
- 2016 - 2018 京都大学大学院 医学研究科 医科学専攻 修士課程
- 2012 - 2016 Kyoto University Faculty of Agriculture Faculty of Agriculture
- 2009 - 2012 海城高等学校
Professional career (3):
- 博士(医科学) (京都大学)
- 修士(医科学) (京都大学)
- 学士(農学) (京都大学)
Work history (2):
- 2021/04 - 現在 京都大学大学院医学研究科 ゲノム医学センター 助教
- 2019/04 - 2021/03 日本学術振興会特別研究員DC2
Awards (1):
- 2021 - 第2回京都大学医薬系研究交流サロン Best Presentation Award
Association Membership(s) (3):
日本基礎老化学会
, 日本人工知能学会
, 日本人類遺伝学会
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