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J-GLOBAL ID：202101018168237901
Update date: Apr. 28, 2024
Tanaka Kotaro
タナカ コウタロウ | Tanaka Kotaro
Research field (2)：
Biophysics
, Structural biochemistry
Research theme for competitive and other funds (4)：
- 2023 - 2027 Membrane permeation mechanism mediated by large pore channels contributed by phospholipids
- 2023 - 2026 クライオ電子顕微鏡像の構造多型・揺らぎ解析によるギャップ結合チャネル開閉機構解明
- 2022 - 2023 Protein Structure Determination by Cryo-EM with Supercomputer Flow
- 2013 - 2016 コフィリンが飽和結合したアクチン繊維の分子間相互作用を近原子分解能で解き明かす
Papers (6)：
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Shota Suzuki, Kotaro Tanaka, Kouki Nishikawa, Hiroshi Suzuki, Atsunori Oshima, Yoshinori Fujiyoshi. Structural basis of hydroxycarboxylic acid receptor signaling mechanisms through ligand binding. Nature Communications. 2023. 14. 1
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Yusuke Kanematsu, Akihiro Narita, Toshiro Oda, Ryotaro Koike, Motonori Ota, Yu Takano, Kei Moritsugu, Ikuko Fujiwara, Kotaro Tanaka, Hideyuki Komatsu, et al. Structures and mechanisms of actin ATP hydrolysis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2022. 119. 43. e2122641119
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Shota Suzuki, Momoko Iida, Yoko Hiroaki, Kotaro Tanaka, Akihiro Kawamoto, Takayuki Kato, Atsunori Oshima. Structural insight into the activation mechanism of MrgD with heterotrimeric Gi-protein revealed by cryo-EM. Communications Biology. 2022. 5. 707. 707-707
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Fujiet Koh, Akihiro Narita, Lin Jie Lee, Kotaro Tanaka, Yong Zi Tan, Venkata P. Dandey, David Popp, Robert C. Robinson. The structure of a 15-stranded actin-like filament from Clostridium botulinum. Nature Communications. 2019. 10. 1. 2856-2856
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Hiroaki Mizuno, Kotaro Tanaka, Sawako Yamashiro, Akihiro Narita, Naoki Watanabe. Helical rotation of the diaphanous-related formin mDia1 generates actin filaments resistant to cofilin. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2018. 115. 22. E5000-E5007
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MISC (3)：
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安永 卓生, 田中 康太郎, 岩嵜 彩夏, 塚本 崇文, 本多 康久. 巨大システムとしてのクライオ電子顕微鏡法の自動化から自働化への展開. 顕微鏡. 2021. 56. 1. 43-47
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馬水 信弥, 田中 康太郎, 安永 卓生. 単粒子解析におけるタンパク質構造分類のための深層学習アプローチの動向. 顕微鏡. 2020. 55. 3. 104-108
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成田 哲博, 田中 康太郎. コフィリンによるアクチン線維切断とその制御. 生化学. 2019. 91. 1. 109-113
Books (1)：
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Handbook of cryo-electron microscopy
2023 ISBN:9784860438043
Lectures and oral presentations (2)：
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クライオ電子顕微鏡法によるタンパク質構造決定におけるスーパーコンピュータ「不老」の活用検討
(第4回スーパーコンピュータ「不老」ユーザ会 2023)
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潜在変数の自動クラスタリングによる単粒子解析三次元構造分類の自動化の試み
(日本顕微鏡学会 第77回学術講演会 2021)
Education (2)：
- 2011 - 2017 Nagoya University Graduate School of Science
- 2005 - 2011 Nagoya University School of Science Department of Biological Science
Professional career (1)：
- Doctor of Science (Nagoya University)
Work history (3)：
- 2021/06 - 2024/03 Nagoya University Cellular and Structural Physiology Institute Assistant Professor
- 2019/04 - 2021/05 Kyushu Institute of Technology Faculty of Computer Science and Systems Engineering
- 2013/04 - 2016/03 Japan Society for the Promotion of Science
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