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J-GLOBAL ID：202101021297806417
Update date: Nov. 06, 2024
Koide Shota
コイデ ショウタ | Koide Shota
Affiliation and department：
Research field (1)：
Bacteriology
Research keywords (6)：
臨床微生物学
, antimicrobial-resistant bacteria
, group B Streptococcus
, Streptococcus pneumoniae
, whole genome sequencing
, bioinformatics
Research theme for competitive and other funds (1)：
- 2024 - 2027 B群レンサ球菌の妊婦保菌率実態調査と全国ゲノムサーベイランス基盤構築
Papers (23)：
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Mizuki Tanabe, Tomohiro Denda, Yo Sugawara, Daiki Kaji, Kanae Sakaguchi, Shino Takizawa, Shota Koide, Wataru Hayashi, Liansheng Yu, Shizuo Kayama, et al. Temporal dynamics of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli and carbapenemase-producing Gram-negative bacteria in hospital wastewater. The Science of the total environment. 2024. 176901-176901
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Satoshi Nakano, Shota Koide, Yumiko Hosaka, Yuri Hasegawa, Kasumi Ishida-Kuroki, Sayoko Kawakami, Wataru Hayashi, Liansheng Yu, Shizuo Kayama, Noriko Miyashita, et al. Enrichment culture evaluation and characterization of Streptococcus agalactiae among pregnant women in Japan. Journal of medical microbiology. 2024. 73. 7
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Mizuki Tanabe, Tomohiro Denda, Tatsuya Natori, Kazuki Horiuchi, Kanae Sakaguchi, Shota Koide, Yukiko Nagano, Noriyuki Nagano. Commonality of multispecies GES carbapenemase-producing organisms in hospital wastewater with those in previously investigated epidemiologically linked municipal wastewater influents. Journal of global antimicrobial resistance. 2023
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Tomohiro Denda, Tatsuya Natori, Mizuki Tanabe, Kazuki Horiuchi, Shota Koide, Yukiko Nagano, Noriyuki Nagano. Comparative analysis of blaNDM-1-carrying plasmids harbored by four different Acinetobacter species from hospital environments and patients during 2018 to 2022. Journal of global antimicrobial resistance. 2023
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Mizuki Tanabe, Tatsuya Natori, Tomohiro Denda, Kazuki Horiuchi, Shota Koide, Yukiko Nagano, Noriyuki Nagano. A novel blaNDM-1-carrying multidrug-resistant genomic island GIMmSU8481 in a fecal Morganella morganii subsp. sibonii isolate from a patient. Journal of global antimicrobial resistance. 2023
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MISC (34)：
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小出 将太, 中野 哲志, 長谷川 ゆり, 保阪 由美子, 川上 小夜子, 林 航, 于 連升, 鹿山 鎭男, 三浦 清徳, 菅井 基行. 妊婦B群レンサ球菌スクリーニング検査における培養方法の検討. 日本臨床微生物学会雑誌. 2023. 34. Suppl.1. 260-260
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田邊 瑞来, 名取 達矢, 堀内 一樹, 伝田 智宏, 小出 将太, 長野 由紀子, 長野 則之. 重症急性膵炎患者由来バンコマイシン耐性Enterococcus faecium clade A1に認められた新規vanD型耐性遺伝子群保有genomic islandの解析. 日本臨床微生物学会雑誌. 2023. 34. Suppl.1. 277-277
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田邊 瑞来, 名取 達矢, 伝田 智宏, 堀内 一樹, 小出 将太, 長野 由紀子, 長野 則之. Morganella morganii subsp. siboniiに認められた新規blaNDM-1保有多剤耐性genomic islandの解析. 日本臨床微生物学会雑誌. 2023. 34. Suppl.1. 278-278
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伝田 智宏, 田邊 瑞来, 名取 達矢, 堀内 一樹, 小出 将太, 長野 由紀子, 長野 則之. 同一病棟の環境及び臨床材料由来Acinetobacter spp.が保有するblaNDM-1プラスミドの時空間比較解析. 日本臨床微生物学会雑誌. 2023. 34. Suppl.1. 302-302
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田邊瑞来, 伝田智宏, 小出将太, 長野由紀子, 長野則之, 長野則之. 新規Genomic Islands中にvanD型耐性遺伝子群を保有するEnterococcus faecium pandemic clone CC17の出現. 日本感染症学会東日本地方会学術集会・日本化学療法学会東日本支部総会合同学会プログラム・抄録集. 2023. 72nd-70th
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Education (3)：
- 2020 - 2023 Shinshu University Graduate School of Medicine, Science and Technology
- 2017 - 2019 Shinshu University Graduate School of Medicine Health Sciences
- 2013 - 2017 Shinshu University School of Medicine Department of Health Sciences
Professional career (1)：
Work history (2)：
- 2023/04 - 現在 National Institute of Infectious Diseases
- 2019/04 - 2023/03 長野県立こども病院 臨床検査科 臨床検査技師
Awards (1)：
- 2019/02 - 日本臨床微生物学会 2019年度 創立四半世紀記念研究成果発表奨励賞
Association Membership(s) (5)：
日本ゲノム微生物学会
, The Japanese Association for Infectious Diseases
, Japanese Society for Bioinformatics
, The Society for Bacterial Drug Resistance
, The Japanese Society for Clinical Microbiology
