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J-GLOBAL ID:202103021164322180

Clostridium difficileの遺伝子型タイピング法及びこれに用いるプライマーセット

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 特許業務法人特許事務所サイクス
Gazette classification:特許公報
Application number (International application number):2017125087
Publication number (International publication number):2019004811
Patent number:6945200
Application date: Jun. 27, 2017
Publication date: Jan. 17, 2019
Claim (excerpt):
【請求項1】Clostridium difficileの染色体上の、 (1)genomic isletを構成するORF、および (2)genomic island中に存在するhyper variableなORFを構成するORF、 の有無を任意の順で検出し、これらORFの有無の組み合わせにより遺伝子型別分類を行うステップを含む、Clostridium difficileの菌株識別のための方法であって、前記(1)のORFにおける genomic isletがCD196_0620、CD630_36250、CD196_1458、CD630_33700、CD196_1802、CD630_25270、CD630_06080、CD630_31360、配列番号1およびCD196_2957からなる10種の遺伝子であり、前記(2)のgenomic island中に存在するhyper variableなORFがCD196_0825、CD630_09400、CD630_09720、CD630_09290、CD196_1456およびCD630_09360からなる6種の遺伝子である、方法。
IPC (4):
C12Q 1/689 ( 201 8.01) ,  C12Q 1/686 ( 201 8.01) ,  C12N 15/09 ( 200 6.01) ,  C12R 1/145 ( 200 6.01)
FI (4):
C12Q 1/689 ZNA Z ,  C12Q 1/686 Z ,  C12N 15/09 Z ,  C12R 1:145
Patent cited by the Patent:
Cited by examiner (5)
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Article cited by the Patent:
Cited by examiner (2)

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