ChIP-seq SRAの統合的可視化とバイオデータベースとの連携

Study period：2015 - 2015
Organization (1)：
Principal investigator： ( , 大学院医学研究院, 助教 )
Research overview：

国際塩基配列データベースに登録されている、ChIP-seq解析(次世代シークエンサを用いたクロマチン免疫沈降法)の生データ全てをスパコンで計算処理する。その結果をウェブサイトを通じて公開し、どのタンパク質がゲノム上のどこに結合しているかが一目でわかるように可視化させる。また、全てのデータについて抗原名や細胞組織名などの情報を付加することで、絞り込み検索を可能にするだけでなく、統合化推進プログラムで開発されたデータベースとの連携を充実させる。

, , , ,

Research program：＞＞
Parent Research Project： DICP Tool Prototype Trial for Integrated Database Analysis
Organization with control over the research：

Japan Science and Technology Agency

Reports ：

2015 Completion report

Return to Previous Page