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J-GLOBAL ID:202203000782819346
疾患リスク評価のための腸内細菌叢のタイプ分類方法
Inventor:
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Applicant, Patent owner:
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Agent (1):
弁理士法人平木国際特許事務所
Gazette classification:特許公報
Application number (International application number):2021106050
Patent number:7193810
Application date: Jun. 25, 2021
Summary:
【課題】モンゴロイド、特に日本人の腸内細菌叢に関する網羅的な解析に基づいて、腸内細菌叢と疾患リスクの関係を明らかにし、腸内細菌叢の情報から疾患リスクを推定する方法を開発し、提供することを課題とする。
【解決手段】被験試料から得られた腸内細菌の存在比率をもとに、被験試料が属する腸内細菌叢のタイプを分類し、腸内細菌叢のタイプと疾患リスクの相関情報に基づき、被験試料が由来する被験者の疾患リスクを評価する。
【選択図】なし
Claim (excerpt):
【請求項1】 疾患リスク評価のための腸内細菌叢のタイプ分類方法であって、 被験試料から核酸を抽出する核酸抽出工程、 前記核酸の配列情報に基づき、全核酸に対する特定の細菌由来の核酸の存在比率を測定する測定工程、及び 5タイプ、10タイプ及び15タイプからなる評価グループ群から選択される評価グループを選択する選択工程、 前記存在比率と、予め定められた基準値に基づいて、前記被検試料の腸内細菌叢のタイプを分類する分類工程を含み、前記疾患が、虚血性心疾患、心不全、NAFLD、ALD、VLD、FD、IBS、慢性便秘、甲状腺障害、パーキンソン病、双極性障害、認知症、UC、クローン病、UC及びクローン病からなる炎症性疾患、リウマチ、胃癌、肝癌、十二指腸癌、食道癌、大腸癌、胆のう癌、肺癌、膵臓癌、高血圧、高脂血症、高尿酸血症、糖尿病、高BMI、並びに高血圧、高脂血症、高尿酸血症、糖尿病及び高BMIからなる生活習慣病からなる群から選択される一以上の疾患であり、 前記特定の細菌は、Actinomyces、Alistipes、Anaerostipes、Anaerotruncus、Bacteroides、Bifidobacterium、Bilophila、Blautia、Butyricicoccus、Butyricimonas、Clostridium、Collinsella、Coprobacillus、Coprococcus、Dialister、Dorea、Eggerthella、[Eubacterium]、Faecalibacterium、Gemmiger、Granulicatella、Holdemania、Lachnospira、Lactobacillus、Odoribacter、Oscillospira、Parabacteroides、Phascolarctobacterium、Prevotella、Roseburia、Ruminococcus、[Ruminococcus]、Streptococcus、Sutterella、Turicibacter、及びVeillonellaであり、前記5タイプ、10タイプ及び15タイプからなる評価グループ群における腸内細菌の存在比率は、それぞれ表1~3に示され、前記5タイプ、10タイプ及び15タイプからなる評価グループにおける、タイプと前記疾患のリスクの相関情報は、それぞれ表4~6で示され、表4~6中、空欄はリスクがないことを示し、Aは最もリスクが高いことを示し、Cは最もリスクが低いことを示し、BはA及びCに属さないことを示し、 前記予め定められた基準値は、前記選択された評価グループにおいて前記特定の細菌ごとに定められ、前記[Eubacterium]はHoldemanelaである、前記タイプ分類方法。
IPC (4):
C12Q 1/06 ( 200 6.01)
, G01N 33/50 ( 200 6.01)
, C12Q 1/6851 ( 201 8.01)
, C12N 15/31 ( 200 6.01)
FI (4):
C12Q 1/06 ZNA
, G01N 33/50 Z
, C12Q 1/685 Z
, C12N 15/31
Patent cited by the Patent:
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