情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム

Inventor： ,
Applicant, Patent owner：
Agent (3)：西澤和純 , 飯田雅人 , 酒井太一
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：2021040558
Publication number (International publication number)：2022139956
Application date： Mar. 12, 2021
Publication date： Sep. 26, 2022
Summary：

【課題】ウイロイドの病原性をより迅速に評価すること。【解決手段】情報処理装置は、宿主植物に対する病原性が既知である複数の第1ウイロイドの其々のゲノム塩基配列から複数の断片を生成する生成部と、前記宿主植物のゲノム塩基配列上において、前記生成部によって前記第1ウイロイドのゲノム塩基配列から生成された各断片に対して相同性を有する塩基配列の位置を算出する第1算出部と、前記第1算出部によって算出された前記宿主植物のゲノム塩基配列上の塩基配列の位置に基づいて、前記複数の第1ウイロイドの其々の特徴量を算出する第2算出部と、前記第2算出部によって算出された前記特徴量に基づいて、前記複数の第1ウイロイドの中で、前記病原性が互いに同じ又は類似する第1ウイロイドを同一クラスタに分類する分類部と、を備える。【選択図】図1

Claim (excerpt)：

宿主植物に対する病原性が既知である複数の第1ウイロイドの其々のゲノム塩基配列から複数の断片を生成する生成部と、前記宿主植物のゲノム塩基配列上において、前記生成部によって前記第1ウイロイドのゲノム塩基配列から生成された各断片に対して相同性を有する塩基配列の位置を算出する第1算出部と、前記第1算出部によって算出された前記宿主植物のゲノム塩基配列上の塩基配列の位置に基づいて、前記複数の第1ウイロイドの其々の特徴量を算出する第2算出部と、前記第2算出部によって算出された前記特徴量に基づいて、前記複数の第1ウイロイドの中で、前記病原性が互いに同じ又は類似する第1ウイロイドを同一クラスタに分類する分類部と、を備える情報処理装置。

IPC (2)：

C12M 1/00 , C12Q 1/68

FI (2)：

C12M1/00 A , C12Q1/68 100Z

F-Term (11)：

4B029AA07 , 4B029BB01 , 4B029FA01 , 4B029HA10 , 4B063QA13 , 4B063QA20 , 4B063QQ04 , 4B063QQ10 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QS36

Patent cited by the Patent：

Cited by applicant (1)

国際公開第2010/140518号

Cited by examiner (3)

日本カンキツウイロイド2(JCVd2)遺伝子
Gazette classification：公開公報 Application number：特願平10-349472 Applicant：農林水産省果樹試験場長
ウイロイド検出方法およびウイロイド検出に用いるキャプチャープローブ
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2000-010011 Applicant：和歌山県農業協同組合連合会
植物由来菌の菌量の推定方法
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2018-172782 Applicant：ポーラ化成工業株式会社

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (2)

植物防疫, 2017, Vol. 71, No. 10, p. 641-645
Virus Evolution, 20210125, Vol. 7, No. 1, p. 1-14

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