清水厚志

シミズアツシ | Shimizu Atsushi

所属機関・部署：
職名：教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (2件)：

国立遺伝学研究所日本DNAデータバンク
慶應義塾大学医学部衛生学公衆衛生学教室客員教授

ホームページURL (1件)： http://researchmap.jp/atsushi_ngs/

研究分野 (4件)：ゲノム生物学 , システムゲノム科学 , 医化学 , 胎児医学、小児成育学

研究キーワード (6件)：バイオインフォマティクス , 次世代シークエンサー , 疫学 , 遺伝医学 , ゲノム医学 , Molecular genetics

競争的資金等の研究課題 (35件)：

2025 - 2028 DNAメチル化経時変化に基づく健康・老化状態の理解と介入ターゲットの探索
2023 - 2028 NCDs・フレイル予防の共通経路としての代謝物バイオマーカーの有用性評価と検証
2022 - 2028 コホート・生体試料支援プラットフォーム
2025 - 2028 マルチオミクスコホートデータベースを利活用した心不全重症化に関連する遺伝的リスク因子の解明
2023 - 2026 ポリジェニックリスクスコアを用いた骨粗鬆症骨折発症予防プログラムの基盤構築

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論文 (185件)：

Ikuko Mizuta, Fumio Yamashita, Yoichi Sutoh, Atsushi Shimizu, Akiko Watanabe-Hosomi, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Shunji Mugikura, Kengo Kinoshita, Makiko Taira, Naoko Mori, et al. Significant Correlation Between White Matter Hyperintensity Volume and Rare NOTCH3 Variants in the General Japanese Population. Geriatrics & gerontology international. 2026. 26. 2. e70400
Taira Mayanagi, Junko Yagi, Hideki Ohmomo, Manami Akasaka, Kentaro Fukumoto, Shusaku Chiba, Shohei Komaki, Atsushi Shimizu, Takehito Yanbe, Mare Uchide, et al. Inter-individual differentially methylated region-targeted EWAS reveals epigenetic signatures of early childhood adversity. Epigenomics. 2026. 1-12
Hiroshi Okumiyama, Ryosuke Fujii, Mako Nagayoshi, Masahiro Nakatochi, Yoshiki Tsuboi, Koji Suzuki, Hiroaki Ikezaki, Takuma Furukawa, Rieko Okada, Shiroh Tanoue, et al. Integration of polygenic risk score with measured blood pressure reveals hidden risks of cardiovascular disease mortality: A Japanese prospective cohort study. Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension. 2025
Hideki Ohmomo, Shohei Komaki, Shiori Minabe, Yoichi Sutoh, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Makoto Sasaki, Atsushi Shimizu. Exploring novel blood-based DNA methylation biomarkers for alzheimer's disease via targeted sequencing of highly variable CpG sites. BMC research notes. 2025. 18. 1. 350-350
Yoichi Sutoh, Tsuyoshi Hachiya, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Shohei Komaki, Shiori Minabe, Hideki Ohmomo, Kozo Tanno, Atsushi Hozawa, Naoki Nakaya, Aoi Noda, et al. Genetic predisposition for immunoglobulin E production explains atopic risk in children: Tohoku Medical Megabank cohort study. American journal of human genetics. 2025. 112. 8. 1852-1863

MISC (216件)：

永田雅俊, 小巻翔平, 西田裕一郎, 大桃秀樹, 原めぐみ, 田中恵太郎, 清水厚志. エピジェネティック・クロックによる生物学的年齢と身体活動の関連解析. 日本衛生学雑誌(Web). 2025. 80. Supplement
古川拓馬, 古川拓馬, 田中恵太郎, 西田裕一郎, 島ノ江千里, 大桃秀樹, 清水厚志, 原めぐみ. 末梢血DNAメチル化と糖尿病との関連:エピゲノムワイド関連解析. 日本疫学会学術総会講演集(Web). 2025. 35th
大桃秀樹, 大桃秀樹, 原田成, 小巻翔平, 小巻翔平, 小野加奈子, 美辺詩織, 美辺詩織, 須藤洋一, 須藤洋一, et al. DNAメチル化解析および遺伝子発現解析を用いた加熱式たばこへの切り替えによる分子遺伝学的影響の解明. 日本疫学会学術総会講演集(Web). 2025. 35th
清水厚志, 清水厚志, 小巻翔平, 小巻翔平, 荒木重則, 美辺詩織, 美辺詩織, 山崎弥生, 山崎弥生, 須藤洋一, et al. エピゲノム年齢の回付による個別化予防の実現に向けたフィージビリティ・スタディ. 日本遺伝カウンセリング学会誌. 2025. 46. 2
須藤洋一, 須藤洋一, 小野加奈子, 美辺詩織, 美辺詩織, SENANAYAKE Samadhi, SENANAYAKE Samadhi, 大桃秀樹, 大桃秀樹, 八谷剛史, et al. ウミヤツメ(Petromyzon marinus)ゲノムに見られるProto-MHC的特徴. 日本比較免疫学会学術集会講演要旨. 2025. 36th

特許 (2件)：

腎細胞癌の診断マーカー及びそれを用いた診断方法
脳梗塞発症リスクの予測モデル作成方法および予測方法

書籍 (7件)：

がんゲノムデータ解析
メディカルサイエンスインターナショナル 2022 ISBN:4815730520
次世代シークエンサーDRY解析教本
学研メディカル秀潤社 2019 ISBN:478090983X
実験医学増刊 Vol.35 No.17 ヒト疾患のデータベースとバイオバンク〜情報をどう使い、どう活かすか?ゲノム医療をどう実現するか?
羊土社 2017 ISBN:4758103666
次世代シークエンサーDRY解析教本 (細胞工学別冊)
学研メディカル秀潤社 2015 ISBN:4780909201
実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」ヒトゲノム・オミックス情報のコホート研究への応用.
羊土社 2014

講演・口頭発表等 (122件)：

脳梗塞のゲノム疫学研究
(第54回日本動脈硬化学会総会・学術集会 2022)
ポリジェニックリスクスコアのがん予防や治療への実装と課題
(日本人類遺伝学会第66回大会第28回日本遺伝子診療学会大会合同開催 2021)
大規模ゲノムコホート連携と遺伝情報を活用した疾患発症リスク予測モデルによる個別化予防の実現
(第123回慶應義塾大学医学部生涯教育研修セミナー 2021)
いわて東北メディカル・メガバンク機構(IMM)におけるコホート検体の複合オミックス解析
(慶應義塾大学システム医療研究開発センターセミナー 2016)
ヒトゲノム情報を活用した次世代型予防医療の実現に向けて
(成育医療センター特別セミナー 2016)

学歴 (2件)：

1994 - 1999 青山学院大学大学院理工学研究科化学専攻
1900 - 1994 青山学院大学理工学部化学・生命科学科

学位 (1件)：

博士(理学) (青山学院大学)

経歴 (15件)：

2026/04 - 現在東北大学東北メディカル・メガバンク機構教授
2025/09 - 現在慶應義塾大学医学部衛生学公衆衛生学教室客員教授
2022/04 - 現在国立遺伝学研究所生命情報・DDBJセンター特命教授
2020/05 - 2026/03 東北大学東北メディカル・メガバンク機構
2020/01 - 2025/12 岩手医科大学医歯薬総合研究所生体情報解析部門教授

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委員歴 (4件)：

2022/01 - 現在日本疫学会疫学リソース利用促進委員会リンケージ基盤推進ワーキンググループ委員
2019/11 - 現在日本人類遺伝学会利益相反委員会委員
2019/11 - 現在日本人類遺伝学会評議員
2018/04 - 2020/03 日本バイオインフォマティクス学会理事

受賞 (1件)：

2023/06 - 日本抗加齢医学会第23回日本抗加齢医学会総会最優秀演題賞日本人に最適化した新規エピゲノムクロックの開発

所属学会 (9件)：

NGS現場の会 , 日本オミックス医療学会 , 日本エピジェネティクス研究会 , 慶應医学会 , 日本分子生物学会 , 米国人類遺伝学会 , 日本遺伝子診療学会 , 日本人類遺伝学会 , 日本遺伝カウンセリング学会

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