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J-GLOBAL ID：201302217743023955   整理番号：13A0579434

GeneCardsにおけるヒトncRNA遺伝子の非冗長一覧

Non-redundant compendium of human ncRNA genes in GeneCards

著者 (12件)： BELINKY Frida (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  BAHIR Iris (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  STELZER Gil (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  ZIMMERMAN Shahar (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  ROSEN Naomi (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  NATIV Noam (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  DALAH Irina (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  STEIN Tsippi Iny (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  RAPPAPORT Noa (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  MITUYAMA Toutai (Advanced Industrial Sci. and Technol. (AIST)Tokyo, JPN) ,  SAFRAN Marilyn (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR) ,  LANCET Doron (Weizmann Inst. of Sci., Rehovot, ISR)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 2  ページ： 255-261  発行年： 2013年01月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非翻訳RNA(ncRNA)遺伝子はヒトゲノムにおいてますます重要になっているが,全てのヒト遺伝子に対する包括的非冗長データベースは存在しない。そこで,ヒト遺伝子一覧GeneCardsデータベース,fRNAabデータベース,追加的一次ソースを利用して15ソースから入手できる全てのncRNA遺伝子エントリーを注意深く統合した。重複エントリーをゲノム座標によるアルゴリズムで統一遺伝子位置にクラスタ化した結果,GeneCardsのエントリー範囲が5倍増加し,14クラスに属する~80000ヒト非冗長ncRNAが得られた。これらの非翻訳RNAはアノテーションとともにGeneCards V3.09の~122500エントリーの中に含まれ,100データソースから組み込みパイプラインによって自動的にデータマイニングされる。

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,  冗長性 ,  ヒト ,  *ゲノム ,  遺伝学 ,  オントロジー ,  アルゴリズム ,  データベース ,  *クラスタ化 ,  遺伝子 ,  遺伝学実験技術 ,  統合 ,  piRNA ,  オーバーラップ遺伝子 ,  *ヒトゲノム ,  遺伝子オントロジー ,  *非翻訳RNA ,  遺伝子マッピング ,  ゲノミクス ,  自然科学 ,  *改変
準シソーラス用語： ゲノムマッピング ,  ゲノム解析

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： ヒト ,  ncRNA ,  遺伝子 ,  冗長