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J-GLOBAL ID：201602282044858101   整理番号：16A0863090

桃脂Yangシンターゼの遺伝子ファミリーの生物情報学とその発現特性分析。【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis of the lipoxygenase gene family and their gene expression characteristics analysis in peaches

著者 (5件)： Guo Shaolei (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University; Jiangsu Key Laboratory for Horticultural Crop Genetic Improvement) ,  Zhang Binbin (Institute of Horticulture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences/Jiangsu Key Laboratory for Horticultural Crop Genetic Improvement) ,  Ma Ruijuan (Institute of Horticulture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences/Jiangsu Key Laboratory for Horticultural Crop Genetic Improvement) ,  Yu Mingliang (Institute of Horticulture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences/Jiangsu Key Laboratory for Horticultural Crop Genetic Improvement) ,  Song Zhizhong (Institute of Horticulture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences/Jiangsu Key Laboratory for Horticultural Crop Genetic Improvement)
資料名： Guoshu Xuebao  (Guoshu Xuebao)
巻： 33  号： 3  ページ： 257-267  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2018A  ISSN： 1009-9980  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】リポキシゲナーゼ(LIPOXYGENASE;;LOXLINOLEATE OXYGEN OXIDOREDUCTASE;EC1.13.11.12)は1種類の重要な酵素として,広く植物成長発育、成熟、老化及び植物ストレス耐性過程に関与し,その重要な役割はずっと国内外の研究の重点と焦点である。研究はバイオインフォマティクス法を利用してモモのLOX遺伝子ファミリーに対して発掘を行ってとを予測し,モモのLOXファミリー遺伝子の同定と機能解析のために基礎情報を提供することを目指し,分子レベル上ではモモの品種改良およびポストハーベスト新鮮保持のために明確な候補遺伝子を提供する。【方法】バイオインフォマティクス法を用いて,QRT-PCR桃特異組織中のLOX遺伝子ファミリーの発現パターンを研究する技術を用いて、モモLOXの遺伝子ファミリーのメンバー数と、系統進化関係仮定蛋白質構造分類を研究した。【結果】モモのLOX遺伝子ファミリーは13個の想定蛋白質を含む,9-LOXと13-LOXのタイプはそれぞれにあった,6つのメンバーは,1つの特殊なタイプが存在しまた,リンゴと類似性を有する;モモのLOX蛋白質のアミノ酸配列の一致性は33.76%~90.84%であった;13-LOXのタイプと各等電点は13個のLOXファミリーメンバーのほとんどは両性アミノ酸であり,9-LOXタイプの6つのファミリーのメンバーの理論的等電点はすべて7未満であり,規則がなかった;PPA017962Mを除いて13個のタンパク質の二次構造はランダムコイルで主要構成素子である;染色体局在性分析により,LOXファミリーの遺伝子は,モモの8つの染色体上に分布して平均決して,6番染色体上のモモのLOX遺伝子分布中で最も多く,また,PPAは017962M,いかなる特異的染色体にも位置していなかった;QRT-PCRの組織特異的発現結果は主に果実と茎中のLOX遺伝子ファミリーの相対的発現量が比較的高いことを示した。【結論】13個のモモLOXファミリー遺伝子を同定した,そのモモの染色体上に不均一的に分布する;分離果実と茎の発現は主にモモLOX遺伝子多数;PPA001634MとPPA 001016PPA001082M、PPA001216M、M、PPA017962M果実中での発現量が最も高く,モモ果実軟化過程を老化調節に関与する可能性がある。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 染色体 ,  等電点 ,  リンゴ ,  育種 ,  リポキシゲナーゼ ,  系統発生 ,  *遺伝子 ,  *合成酵素 ,  機能分析 ,  アミノ酸配列
準シソーラス用語： 蛋白質構造 ,  候補遺伝子 ,  ストレス耐性 ,  *バイオインフォマティクス ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Peach ,  LOX gene family ,  Bioinformatics ,  Gene expression

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 桃 ,  脂 ,  シンターゼ ,  遺伝子ファミリー ,  生物情報学 ,  発現 ,  分析